柑橘病害會影響葉子和果實的健康,由于其癥狀影響,繼續(xù)對柑橘種植者的生產(chǎn)力和經(jīng)濟穩(wěn)定構(gòu)成威脅。黃龍病 (HLB) 或柑橘綠化病對柑橘樹是致命的,且缺乏治愈方法,并已多次復(fù)發(fā),造成樹木毀壞 。它是一種普遍存在的威脅,由細(xì)菌病原體引起,會在葉片、莖和果實上引起壞死性病變。受感染的葉片形狀不規(guī)則、發(fā)育不良或起皺。嚴(yán)重的感染會導(dǎo)致不良后果,如葉片脫落、果實過早脫落、樹枝腐爛、整棵樹衰弱以及果實上出現(xiàn)斑點。由柑橘球腔菌引發(fā)的油斑病和由柑橘黑斑病引起的柑橘黑斑病也使柑橘樹面臨著一系列挑戰(zhàn)。由真菌引起的瘡痂病對檸檬品種、朗布爾酸橙和粗糙檸檬砧木構(gòu)成了明顯威脅,導(dǎo)致果實、葉片和樹枝上出現(xiàn)類似瘡痂或疣的不規(guī)則突起,常伴有葉片扭曲。在佛羅里達(dá)州,缺鋅最初表現(xiàn)為葉片綠色葉脈之間出現(xiàn)小黃斑,逐漸發(fā)展為除綠色葉脈區(qū)域外的整體變黃,缺鋅情況會逐漸惡化。柑橘病害不僅影響產(chǎn)量,颶風(fēng)、冬季霜凍、小雪、雨夾雪和凍雨等惡劣天氣條件以及勞動力短缺也會導(dǎo)致產(chǎn)量下降。因此,確保柑橘的盈利能力和市場競爭力的關(guān)鍵在于對受感染水果的有效控制和識別??煽?、準(zhǔn)確地檢測病害感染至關(guān)重要,因為這些可以通過人為干預(yù)來預(yù)防,而天氣條件則無法控制。然而,一般的檢測方法依賴于人工檢查,這容易出現(xiàn)人為錯誤,或者依賴于電子顯微鏡或聚合酶鏈反應(yīng)等傳統(tǒng)方法,這些方法既耗時又昂貴,而且需要實驗室技能。在考慮病害檢測的長期最終策略時,需要能夠以更快的速度準(zhǔn)確、不知疲倦地對柑橘病害進行分類的自動化系統(tǒng)。
大多數(shù)關(guān)于葉片病害檢測方法的研究都側(cè)重于利用圖像分類和識別技術(shù)的視覺或彩色數(shù)字成像。HSI 系統(tǒng)已被證明是一種可靠、準(zhǔn)確且無損的方法,可以進行高光譜分辨率的深入光譜分析。此外,熒光成像系統(tǒng)已被廣泛用于評估植物葉片在環(huán)境壓力或病害條件下的生理特性。當(dāng)特定波長激發(fā)葉綠素分子時,葉綠素會發(fā)出不同波長范圍的光。這些光譜特征可以在寬光譜范圍內(nèi)表征疾病的存在,得益于 HSI 的能力,這些光譜特征可以執(zhí)行疾病檢測和分類任務(wù) 。先前的研究已經(jīng)探索了多光譜檢測以評估柑橘病害對葡萄柚的影響,分類準(zhǔn)確率達(dá)到 95.7% 。這項研究展示了雙波段多光譜成像的潛力。Thomas 等人還探索了一種結(jié)合反射和透射的高光譜成像系統(tǒng)來研究植物病原體。他們的發(fā)現(xiàn)表明,基于反射率的測量有助于早期檢測,而透射率測量則為理解和量化植物-病原體相互作用的復(fù)雜時空動態(tài)提供了補充見解。 Bauriegel 和 Herppich 利用高光譜和葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)對小麥赤霉病進行了早期檢測 。他們在實驗室環(huán)境中使用高光譜成像系統(tǒng)測量鐮刀菌,在田間使用葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)測量鐮刀菌。現(xiàn)有的高光譜和熒光系統(tǒng)需要復(fù)雜的設(shè)置和單獨操作,導(dǎo)致數(shù)據(jù)收集時間更長,并且需要手動對齊數(shù)據(jù),從而降低準(zhǔn)確性。
此外,準(zhǔn)確區(qū)分健康葉片和受感染葉片或具有相似可見癥狀的葉片疾病仍然是一項具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。近年來,包括支持向量機 (SVM)、k 最近鄰 (KNN)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) (ANN) 和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) (CNN) 在內(nèi)的機器學(xué)習(xí)方法加速并推進了自動化系統(tǒng)的發(fā)展,并在疾病檢測任務(wù)中取得了可喜的成果 。在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,HSI 與機器學(xué)習(xí)相結(jié)合已被證明是一種高度準(zhǔn)確的方法,可用于檢測和分類各種葉片上的疾病,如柑橘 、葡萄、紅樹林、南瓜等。謝等人利用 HSI 檢測番茄葉片上的疾病,并應(yīng)用了全光譜的極限學(xué)習(xí)機 (ELM) 模型以及針對選定波長的連續(xù)投影算法 (SPA)-ELM。在測試數(shù)據(jù)中,ELM 模型的準(zhǔn)確率 (100%) 高于 SPA-ELM 模型 (97.1%)。SPA-ELM 方法具有模型簡化、計算時間短以及開發(fā)基于多光譜的檢測儀器的潛力。吳等采用 ELM、SVM 和 KNN 的反射率 HSI 檢測草莓葉片上的灰霉病。三種機器學(xué)習(xí)分類器在測試集中的準(zhǔn)確率超過 90%。劉等還展示了將反射率 HSI 與機器學(xué)習(xí)模型結(jié)合使用在評估蘋果葉片上與蘋果花葉病相關(guān)的葉綠素含量方面的潛力。使用基于多種波長、平均葉片葉綠素含量及其組合的隨機森林模型從驗證數(shù)據(jù)集獲得了最高的準(zhǔn)確率(98.89%)。陳等研究了一種帶有機器學(xué)習(xí)模型的熒光成像系統(tǒng),即一種采用 ResNet50 進行遷移學(xué)習(xí)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),用于識別受黃瓜霜霉病感染的葉片。植物因病害應(yīng)激而產(chǎn)生的葉綠素?zé)晒鈪?shù)為植物的生理特性提供了寶貴的信息。這些參數(shù)被用作深度學(xué)習(xí)模型的輸入,增強型 ResNet 模型的準(zhǔn)確率達(dá)到了 94.76%,有助于早期疾病檢測。Weng 等人使用三個 650 nm 的 LED 對柑橘 HLB 葉片進行了葉綠素?zé)晒鉁y量。最小二乘支持向量機對臍橙的準(zhǔn)確率達(dá)到 95.0%,對無核小蜜柑的準(zhǔn)確率達(dá)到 96%。
雖然已經(jīng)有大量研究僅研究基于反射或熒光的高光譜測量,但對于在單一系統(tǒng)中同時使用反射和熒光成像來識別葉片疾病的潛在用途的研究卻非常有限。同時使用高光譜反射和熒光成像可以帶來區(qū)分疾病的優(yōu)勢(例如,分類準(zhǔn)確度高)。本研究探索了便攜式高光譜反射和熒光成像系統(tǒng)與機器學(xué)習(xí)相結(jié)合在區(qū)分柑橘葉片上各種疾病方面的潛力。使用高光譜成像系統(tǒng)測試了感染六種不同疾病的葉子的正面和背面以及健康對照組。使用機器學(xué)習(xí)分類器研究了高光譜葉片圖像。
材料和方法
2.1. 便攜式高光譜成像系統(tǒng)
本研究開發(fā)了一種便攜式高光譜成像系統(tǒng)。該系統(tǒng)由兩個 LED 光源組成:用于反射的可見光和近紅外 (VNIR) 寬帶光,以及用于熒光的紫外線 A (UV-A) 激發(fā)光。VNIR LED 的波長設(shè)置為 428、650、810、850、890、910 和 940 nm,而 UV-A 的波長設(shè)置為 365 nm??梢允褂脙蓚€數(shù)字調(diào)光控制器調(diào)整 LED 強度,每個控制器管理三個通道。第一個控制器處理 365、428 和 650 nm 的波長,而第二個控制器管理 810、850、890、910 和 940 nm 的波長。線光束由棒焦透鏡產(chǎn)生,聚焦在樣品架上的葉子樣品上,并與垂直位置傾斜 6° 重疊。樣品架設(shè)計尺寸為 254 × 197 × 15 mm 3,由 3D 打印機用黑色熱塑性塑料打印而成。定制的反射標(biāo)準(zhǔn)面板尺寸為 254 × 32 × 15 mm 3側(cè)面安裝在樣品架上,用于對反射圖像進行平場校正。使用微型線掃描高光譜相機和焦距 5 mm 的廣角鏡頭以及長通(> 400 nm)明膠濾光片采集反射和熒光信號,相機由成像光譜儀和 CMOS 焦平面陣列探測器組成。長通濾光片用于消除 UV-A 激發(fā)的二階效應(yīng)。為了阻擋環(huán)境光,使用尺寸為 56×36×56 cm3 的鋁框外殼和黑色鋁復(fù)合板來封閉 LED 燈、相機、樣品架、反射板和移動臺,而電源和控制器安裝在外面。這些組件(即兩盞燈、一臺相機和一個載物臺)通過一個有源四端口 USB 集線器連接到筆記本電腦。整個系統(tǒng)安裝在一個緊湊的 45 × 60 cm2光學(xué)面包板上,適合現(xiàn)場和野外實驗。
圖 1. 用于柑橘葉面病害檢測的便攜式高光譜成像系統(tǒng)
系統(tǒng)軟件及操作
圖2顯示了在Windows 11筆記本電腦上使用LabVIEW開發(fā)的系統(tǒng)軟件。為了操作系統(tǒng),使用硬件制造商提供的帶有LabVIEW的軟件開發(fā)工具包(SDK)來實現(xiàn)參數(shù)化和數(shù)據(jù)傳輸功能。SDK包括用于LED燈控制的用戶數(shù)據(jù)報協(xié)議(UDP)、用于攝像頭控制的網(wǎng)絡(luò)協(xié)議、用于平臺移動控制的串行通信以及用于圖像和光譜顯示的LabVIEW視覺開發(fā)模塊(VDM)。在測量過程中,VNIR線燈打開10秒以穩(wěn)定LED輸出。然后平移臺將樣品架向左移動,而高光譜相機從標(biāo)準(zhǔn)面板收集線掃描反射信號并傳遞樣品。當(dāng)樣品架完成通過時,反射圖像采集結(jié)束,并且VNIR燈關(guān)閉。隨后,UV-A線燈打開10秒以穩(wěn)定。然后,當(dāng)平臺返回到起始位置時,相機獲取線掃描熒光信號,完成后關(guān)閉 UV-A 燈,從而結(jié)束一個完整的成像周期。
圖 2. 內(nèi)部開發(fā)的系統(tǒng)控制和高光譜圖像采集軟件
對于預(yù)定的掃描距離,沿平移方向的空間分辨率取決于載物臺移動速度和總掃描次數(shù)。例如,當(dāng)總掃描次數(shù)為 250 線、距離為 250 毫米時,載物臺以 3.3 毫米/秒的速度移動,則大約需要 76 秒,從而得到近似于 1 毫米/像素的空間分辨率。根據(jù)相機的曝光時間,調(diào)整載物臺移動速度,以使連續(xù)線掃描圖像采集與平移載物臺移動同步。根據(jù)經(jīng)驗,確定了移動速度(V,單位為毫米/秒)和曝光時間(T,單位為秒)之間的倒數(shù)關(guān)系(V = 0.99/T),從而當(dāng)曝光時間為 0.3 秒時,速度為 3.3 毫米/秒,當(dāng)曝光時間為 0.6 秒時,速度為 1.65 毫米/秒。除了連續(xù)移動模式外,高光譜系統(tǒng)還能夠以增量逐步線掃描模式運行。該軟件顯示反射率和熒光圖像以及原始光譜和空間輪廓,逐行更新以顯示獲取圖像時的實時掃描進度。完成后,反射率和熒光的每幅圖像都以標(biāo)準(zhǔn)波段逐行交錯 (BIL) 格式保存到單獨的數(shù)據(jù)文件中。
樣品制備與測量
采集了瓦倫西亞橙樹的成熟葉子,這些葉子表現(xiàn)出潰瘍病、HLB、油斑病、黑素病、瘡痂病和缺鋅癥狀,每種葉子都只出現(xiàn)一種癥狀,沒有出現(xiàn)多種感染。葉子樣本經(jīng)過手工采摘并放入冷藏箱的拉鏈袋中,然后在 4 小時內(nèi)轉(zhuǎn)移到實驗室。這些葉子在采集后 48 小時內(nèi)冷藏并拍照。植物病理學(xué)家根據(jù)對每片葉子癥狀的目視檢查來識別疾病。根據(jù)葉子大小,同時對同一類別的 4 到 16 片葉子進行拍照。正面和背面都進行了掃描。對照、潰瘍病、HLB、油斑病、黑素病、瘡痂病和缺鋅類別的葉子總數(shù)分別為 107、105、101、114、117、73 和 125。將柑橘葉樣品放在樣品架上。樣品架和反射板由線性電動平臺在高光譜相機的范圍內(nèi)移動,以進行線掃描圖像采集。鏡頭到樣品的距離固定在 285 毫米,其中沿相機掃描線方向的空間分辨率為 0.33 毫米/像素。每個相機幀捕獲 810 × 348 像素(空間 × 光譜)的感興趣區(qū)域 (ROI),以處理 270 毫米長的瞬時視場和 395 至 1005 nm 的光譜區(qū)域。
以象科技由西安光機所光學(xué)博士團隊,行業(yè)資深專家,光譜軟件算法團隊,光學(xué)應(yīng)用博士等相關(guān)人員共同發(fā)起成立的科技型公司,目前投產(chǎn)市場可見光、近紅外、短波中紅外高光譜相機,實現(xiàn)國產(chǎn)化,突破進口技術(shù)壁壘,打破進口短波紅外高光譜相機的技術(shù)限制。
以象科技是一家集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售于一體的科技型公司。目前經(jīng)營產(chǎn)品有激光共聚焦,激光散斑血流成像儀,光譜儀,高光譜相機等光學(xué)產(chǎn)品。研發(fā)中心設(shè)立于西安,銷售網(wǎng)絡(luò)、完善售后服務(wù)機構(gòu)設(shè)立覆蓋全國。
以象科技作為一家由西安光機所光學(xué)博士團隊、行業(yè)資深專家、光譜軟件算法團隊以及光學(xué)應(yīng)用博士等多元專業(yè)力量共同發(fā)起創(chuàng)立的科技型企業(yè),在光學(xué)技術(shù)領(lǐng)域展現(xiàn)出了非凡的潛力與強勁的實力,正逐步成為行業(yè)內(nèi)的一顆璀璨新星。
其團隊成員憑借深厚的學(xué)術(shù)造詣與豐富的實踐經(jīng)驗,構(gòu)建起了一座堅實的技術(shù)堡壘。西安光機所光學(xué)博士團隊深入鉆研光學(xué)核心原理,在光學(xué)系統(tǒng)的設(shè)計、優(yōu)化以及創(chuàng)新方面持續(xù)發(fā)力,致力于打造出具有性能與高精度的光學(xué)基礎(chǔ)架構(gòu)。行業(yè)資深專家則猶如敏銳的市場領(lǐng)航員,他們憑借對行業(yè)發(fā)展脈絡(luò)的精準(zhǔn)把握以及對市場需求變化的前瞻性洞察,為公司的產(chǎn)品戰(zhàn)略布局指明方向,確保每一款產(chǎn)品都能精準(zhǔn)對接市場痛點,在激烈的市場競爭中脫穎而出。光學(xué)應(yīng)用博士則專注于探索光學(xué)技術(shù)在各個實際領(lǐng)域的落地應(yīng)用,他們深入挖掘產(chǎn)品在不同場景下的潛在用途,從生物醫(yī)學(xué)到工業(yè)制造,從環(huán)境監(jiān)測到農(nóng)業(yè)科技,不斷拓展產(chǎn)品的應(yīng)用邊界,讓光學(xué)技術(shù)真正造福于人類社會的各個角落。
在產(chǎn)品層面,以象科技目前已成功投產(chǎn)并推向市場的可見光、近紅外、短波中紅外高光譜相機,無疑是其技術(shù)實力的集中體現(xiàn)。這不僅為國內(nèi)相關(guān)行業(yè)提供了更為可靠、性價比更高的光學(xué)設(shè)備選擇,還在一定程度上推動了我國光學(xué)技術(shù)自主創(chuàng)新的進程,提升了我國在全球光學(xué)產(chǎn)業(yè)價值鏈中的地位。
此外,公司經(jīng)營的激光共聚焦、激光散斑血流成像儀、光譜儀等光學(xué)產(chǎn)品,也均在各自的領(lǐng)域內(nèi)展現(xiàn)出了優(yōu)勢與性能。激光共聚焦以其超高的分辨率和清晰的成像效果,在生物醫(yī)學(xué)微觀成像領(lǐng)域成為科研人員探索生命奧秘的得力助手;激光散斑血流成像儀能夠精準(zhǔn)地監(jiān)測微循環(huán)血流變化,為醫(yī)學(xué)臨床診斷和疾病研究提供了重要的參考依據(jù);光譜儀則憑借其對物質(zhì)光譜特性的精確分析能力,在材料成分分析、環(huán)境污染物監(jiān)測以及食品安全檢測等領(lǐng)域發(fā)揮著的作用。
以象科技秉持著集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售于一體的全產(chǎn)業(yè)鏈運營模式,展現(xiàn)出了強大的綜合實力與協(xié)同效應(yīng)。其研發(fā)中心坐落于西安這座充滿科技活力與創(chuàng)新氛圍的城市,依托當(dāng)?shù)刎S富的科研資源與人才優(yōu)勢,持續(xù)不斷地投入大量資源進行技術(shù)研發(fā)與創(chuàng)新,為公司的產(chǎn)品迭代升級和技術(shù)突破提供了源源不斷的動力源泉。
與此同時,公司精心構(gòu)建的銷售網(wǎng)絡(luò)如同一張緊密交織的大網(wǎng),全面覆蓋全國各個地區(qū),確保了產(chǎn)品能夠快速、高效地觸達(dá)每一位客戶手中。而完善的售后服務(wù)機構(gòu)則像是一位貼心的守護者,隨時為客戶提供、多層次的技術(shù)支持與售后服務(wù)保障,讓客戶在使用產(chǎn)品的過程中無后顧之憂,進一步增強了客戶對公司品牌的信任度與忠誠度。
以象科技憑借其團隊、創(chuàng)新的產(chǎn)品以及完善的運營模式,在光學(xué)技術(shù)領(lǐng)域正穩(wěn)步前行,未來有望在國內(nèi)乃至全球市場上取得更為輝煌的成就,為推動光學(xué)科技的進步與應(yīng)用普及做出更多貢獻(xiàn)。
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