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        1. 南京信帆生物技術(shù)有限公司
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          PCR法支原體檢測試劑盒*了,歡迎聯(lián)系

          時(shí)間:2017/12/13閱讀:1520
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          PCR法支原體檢測試劑盒*了,歡迎!

          《PCR法支原體檢測試劑盒》

          儲存條件
          該產(chǎn)品在常溫下運(yùn)輸,收到產(chǎn)品后,請立即放-20 ℃冰箱低溫保存。該條件下,至少2年內(nèi)有效。
          產(chǎn)品用途
          《PCR法支原體檢測試劑盒》可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:(1)體外細(xì)胞培養(yǎng)的上清;(2)血清;(3)各種體液,如唾液、尿液、鼻腔分泌物等;(4)別的液體樣品。本產(chǎn)品僅供研究使用。
          產(chǎn)品簡介
          哺乳動物細(xì)胞的培養(yǎng),支原體(Mycoplasma)污染是個(gè)世界性的問題。支原體污染幾乎可以改變細(xì)胞的所有參數(shù),導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不準(zhǔn)確、甚至*錯(cuò)誤。從2013年開始,《Nature》期刊已正式要求投稿的文章,如涉及細(xì)胞培養(yǎng)都要進(jìn)行支原體檢測。相信會有越來越多的高水平期刊將做出同樣的支原體檢測要求。
          培養(yǎng)法是相對可靠的支原體檢測技術(shù),但是該方法非常耗時(shí)的,需要數(shù)周,不適合作為細(xì)胞培養(yǎng)液中支原體污染的快速檢測。此外,通過固體培養(yǎng)法無法檢測污染細(xì)胞的一種zui常見的支原體,即豬鼻支原體(M.Hyorhinis)。這是因?yàn)樨i鼻支原體無法在支原體固體培養(yǎng)基上形成可見的菌落。而豬鼻支原體約占所有支原體污染的20-50%。
          有的實(shí)驗(yàn)室使用熒光染色法檢測支原體,但是該方法靈敏度太低,當(dāng)檢測成陽性時(shí),細(xì)胞經(jīng)常已經(jīng)嚴(yán)重污染。
          目前,細(xì)胞培養(yǎng)液中支原體污染的檢測通常使用的是PCR法。但是PCR法也有明顯的缺點(diǎn):(1)整個(gè)過程大約需要3個(gè)小時(shí);(2)由于細(xì)胞培養(yǎng)數(shù)天后,培養(yǎng)液中經(jīng)常含有嚴(yán)重抑制PCR擴(kuò)增的代謝物,所以樣品的前處理一般是PCR法*的環(huán)節(jié);(3)PCR法的靈敏度有限,通常需要將培養(yǎng)液離心濃縮或者抽提DNA后再檢測;(4)PCR產(chǎn)物的電泳,需要用到EB等潛在的致癌物質(zhì);(5)需要用到PCR儀、電泳槽、凝膠成像儀、離心機(jī)等儀器。

          PCR法支原體檢測試劑盒*了


          本公司已經(jīng)開發(fā)出了于體外細(xì)胞培養(yǎng)的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》,與PCR法支原體檢測相比,其具有許多優(yōu)點(diǎn):耗時(shí)短、靈敏度高、操作簡單、不會被細(xì)胞代謝產(chǎn)物抑制、結(jié)果無需電泳肉眼可直接判斷等。
          盡管如此,《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》可能也有個(gè)小缺點(diǎn):因?yàn)椤兑徊椒ê銣刂гw檢測試劑盒》需要至少同時(shí)使用4條引物才能完成擴(kuò)增,其引物設(shè)計(jì)相對困難。雖然經(jīng)我們測試,該試劑盒至少可認(rèn)識其說明書中列舉的13種支原體,而這13種支原體大約占污染細(xì)胞的支原體種類的99%左右。但是,不排除《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》無法識別個(gè)別在體外細(xì)胞培養(yǎng)中出現(xiàn)概率極低的支原體。為此,我們特意開發(fā)了具有廣譜識別能力的《PCR法支原體檢測試劑盒》作為補(bǔ)充。此外,單獨(dú)使用目前市面上的任何一種支原體檢測試劑盒,都無法做到100%正確,既不會漏檢(假陰性),也不會多檢(假陽性)。嚴(yán)格的支原體檢測,至少需要使用兩種,做好使用三種不同原理的支原體檢測方法同時(shí)進(jìn)行檢測,才能使檢測結(jié)果接近100%正確。
          如果您想得到100%正確的支原體檢測結(jié)果,同時(shí)使用本公司生物試劑的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》和《PCR法支原體檢測試劑盒》進(jìn)行檢測,將會得到比較滿意的結(jié)果。
          試劑盒組成

          • 支原體引物和內(nèi)參(100次):206 μL
          • 陽性支原體DNA:50 μL
          • 注意1:本試劑盒提供的支原體引物和內(nèi)參可供至少100次支原體檢測使用。
          • 注意2:以下試劑需要自己準(zhǔn)備:(1)滅菌的去離子水;(2)普通的Taq DNA 聚合酶和相應(yīng)的緩沖液;(3)2.5 mM的dNTP;(4)6× DNA上樣緩沖液。


          檢測過程:

          • 待測樣品的準(zhǔn)備

          為了準(zhǔn)確判斷細(xì)胞是否有支原體的污染,待測的細(xì)胞培養(yǎng)液樣品來源于至少培養(yǎng)3天且匯合度在70-90%左右的細(xì)胞培養(yǎng)液上清(貼壁細(xì)胞)。懸浮培養(yǎng)的細(xì)胞也需要在換液傳代后,至少讓細(xì)胞生長3天再取培養(yǎng)液進(jìn)行檢測。取150 μL上述待測樣品,在普通臺式離心機(jī)上1200 rpm (大約150-200 g)離心5 min,取離心后的上清100 μL用于支原體檢測,丟棄下層剩余的50 μL(含細(xì)胞沉淀)。收集并已經(jīng)離心去除細(xì)胞的待測樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存,不得放于室溫或4℃冰箱。樣品在-20℃至少可以保存一個(gè)月,在-80℃基本可以保存。

          • 注意:本步驟的低速離心是為了去除哺乳動物細(xì)胞,以排除其不必要的干擾。所以離心力要嚴(yán)格控制在150-200 g,該離心力下,哺乳動物細(xì)胞將被沉淀下來而支原體不會。如果錯(cuò)誤使用更高的離心力將可能導(dǎo)致支原體也被離心下來,從而導(dǎo)致假陰性。

           

          • PCR體系的配制

          請按下表(表1)進(jìn)行PCR體系(總體積25 μL)的配制:
           
              表1.PCR擴(kuò)增體系的配制

           

          Negative Control

          Positive Control

          Sample

          去離子水

          17.5 μL

          15.5 μL

          15.5 μL

          10×Taq DNA 聚合酶緩沖液(含Mg2+)

          2.5 μL

          2.5 μL

          2.5 μL

          2.5 mM dNTP

          2.5 μL

          2.5 μL

          2.5 μL

          5 Units/μL Taq DNA 聚合酶

          0.5 μL

          0.5 μL

          0.5 μL

          支原體引物和內(nèi)參

          2 μL

          2 μL

          2 μL

          陽性支原體DNA或待測樣品

          -

          2 μL

          2 μL

           

           

          • PCR設(shè)置參數(shù)

          1 cycle      94 ℃ for 2 minutes
          35 cylses    94 ℃ for 20 seconds
                       55 ℃ for 20 seconds
                       72 ℃ for 45 seconds
          1 cycle      72 ℃ for 5 minutes
          1 cycle       8 ℃ for ∞
           

          • PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳
          • 配制1.5%含溴化乙錠的DNA瓊脂糖凝膠。
          • 往每個(gè)PCR管內(nèi)加入5 μL 6× DNA上樣緩沖液。
          • 取上述含DNA上樣緩沖液的PCR產(chǎn)物10 μL進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測。
          • 當(dāng)溴酚藍(lán)染料跑出3厘米左右時(shí),停止電泳,拍照。


          結(jié)果判斷
              PCR擴(kuò)增的結(jié)果有可能出現(xiàn)以下幾種情況(表2):
              表2. PCR擴(kuò)增的可能結(jié)果

           

          電泳結(jié)果

          電泳結(jié)果

          電泳結(jié)果

          電泳結(jié)果

          電泳結(jié)果

          電泳結(jié)果

          586 bp內(nèi)參條帶

          ++

          -

          +

          ++

          ++

          -

          270 bp左右條帶

          -

          ++++

          +++

          ++

          +

          -

          結(jié)果圖示(見圖1)

          泳道1

          泳道2

          泳道3

          泳道4

          泳道5

          泳道6

          支原體污染判斷

          陰性

          極重度污染

          重度污染

          中度污染

          輕度污染

          PCR被抑制

           

              注:“-”代表沒有條帶;“+”代表有條帶;“+”號越多代表?xiàng)l帶越強(qiáng)。

          圖1. 支原體PCR擴(kuò)增結(jié)果。586 bp條帶為內(nèi)參條帶,270 bp左右的條帶為支原體特異條帶(各支原體的條帶大小會略有不同,總體在260-280 bp)。隨著支原體DNA模板的增加,270 bp左右的條帶會逐漸增強(qiáng)而586 bp的內(nèi)參條帶會逐漸減弱,甚至消失。泳道1:陰性對照或者沒有支原體污染的樣品;泳道2:極重度支原體污染樣品;泳道3:重度污染樣品;泳道4:中度污染樣品;泳道5:輕度污染樣品;泳道6:PCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制,導(dǎo)致擴(kuò)增失敗。M:DNA marker.
          注意事項(xiàng)

          • 每次檢測都應(yīng)該設(shè)有陰性對照,作用有:(1)由于有效的PCR擴(kuò)增,陰性對照也會有一條586 bp的內(nèi)參條帶,這樣可以保證本試劑盒含有的支原體引物和內(nèi)參以及自己準(zhǔn)備的Taq DNA 聚合酶,dNTP等試劑沒有問題;(2)只有當(dāng)陰性對照的結(jié)果沒有出現(xiàn)270 bp左右的支原體特異條帶時(shí),別的樣品的結(jié)果才是可信的。
          • 如果586 bp條帶和270 bp左右的條帶都沒有出現(xiàn)(如圖1,泳道6),在排除PCR試劑的問題后(即陰性對照可以正常擴(kuò)增),說明該樣品含有抑制PCR擴(kuò)增的代謝產(chǎn)物。有關(guān)PCR的擴(kuò)增會被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制的問題,Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的PCR法支原體檢測試劑盒說明書中也特別提到了這點(diǎn),說明這是一個(gè)PCR法支原體檢測中經(jīng)常遇到的問題,其強(qiáng)烈建議用試劑盒進(jìn)行DNA提取后再進(jìn)行鑒定。這也是PCR法支原體檢測的致命弱點(diǎn)。為了克服該問題,以下問題必須注意:(1)您購買的PCR法支原體檢測試劑盒,其擴(kuò)增產(chǎn)物中必須含有內(nèi)參(Internal Contol)條帶作為對照【本試劑盒的586 bp條帶就是內(nèi)參條帶】。否則,如果沒有內(nèi)參作為對照,即使樣品擴(kuò)增后沒有支原體特異條帶,你也無法確定是因?yàn)闃悠反_實(shí)沒有支原體還是因?yàn)镻CR被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制導(dǎo)致的假陰性。(2)如果出現(xiàn)PCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制時(shí),請使用血液基因組DNA抽提試劑盒,抽提支原體DNA后再進(jìn)行PCR鑒定。(3)同時(shí)使用本公司生物試劑的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》進(jìn)行檢測,經(jīng)嚴(yán)格測試,該試劑盒的擴(kuò)增不會被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制。
          • 本試劑盒與Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的設(shè)計(jì)原理一樣,可以替代后者用于各類支原體的檢測。
          • 根據(jù)支原體DNA的序列,本試劑盒可以識別所有100多種至今已發(fā)現(xiàn)的支原體,具有廣譜的識別能力。
          • 如發(fā)現(xiàn)細(xì)胞被支原體污染,本公司提供細(xì)胞支原體清除和預(yù)防試劑。

          PCR法支原體檢測試劑盒*了

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