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芯片的熒光標記物-菁染料Cy3和Cy5
菁染料是近紅外熒光染料中的一類熒光染料，有的。由于和組織的自發(fā)熒光在近紅外波段小，因此在檢測復雜生物時，近紅外染料能提供的特異性和靈敏度。同時，由于光波在近紅外區(qū)段的組織透過性好。
產(chǎn)品說明：
菁染料是性能的熒光標記染料，摩爾吸光系數(shù)在熒光染料中是的，其琥珀酰亞胺酯是的脂肪氨基標記試劑，用于蛋白、抗體、核酸及其他生物分子的標記和檢測。通過改變次甲基鏈的長度，可改變其熒光發(fā)射波長，每增加一個雙鍵，按照Huoffman 規(guī)則正好紅移約100nm。
磺酸化菁染料和非磺酸化菁熒光染料可以用于標記不同的目標分子：
l 可在有機溶劑中溶解的蛋白質(zhì)
l 抗體 (use 5-10% ofDMSO/DMF)
l DNA和寡核苷酸
l 多肽
l 其他小分子，包括用小分子及
磺酸化菁熒光染料可用于：
Ø 在DMF或DMSO中變性的蛋白
Ø 被透析及純化的蛋白
Ø 水溶性的納米粒子
Ø 不溶或疏水的蛋白
非磺酸化菁熒光染料可用于：
Ø 在有機介質(zhì)反應（二氯甲烷、乙腈）
產(chǎn)品一 Cy3 NHSester （CY3,SE）
Cyanine 是一種屬于聚甲炔基的染料,仍用于工業(yè)以增加感光乳劑的感光范圍(例如增加
波長范圍且使薄膜全色),近用于生物技術(shù)領(lǐng)域.作為熒光染料,Cyanine 已用于生物學成
像.根據(jù)它們的結(jié)構(gòu),cyanines 能覆蓋 UV 到 IR 的光譜范圍.
Cyanine3 NHS ester 可用作反應性染料,用于標記生物分子中的氨基。該試劑通于標記可溶性蛋白\多肽\寡核苷酸或 DNA. Cy3 NHS ester 需要使用有機
共溶劑(例如 DMF 或 DMSO)用于標記,然而,考慮到水溶性sulfo-Cyanine3 NHS ester 在精細蛋白中的使用,此類共溶劑不是必需的.Cy3熒光位于橙色區(qū)域(~550nm 激發(fā), ~570 nm 發(fā)射),而Cy5 是在紅色區(qū)域發(fā)光(~650/670nm),且在橙色區(qū)域吸收(~649nm).Cy3 可以通過配有標準的TRITC濾波器的熒光計\成像儀及顯微鏡檢測.由于其固有的消光系數(shù),甚肉眼也可以很容易地檢測到凝膠和溶液中的 Cy3.
產(chǎn)品名稱 | Cy3 NHS ester | ||
英文名稱 | (2E)-1-[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethyl-5-sulfonatoindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indole-5-sulfonate | ||
Canonical SMILES | CC1(C2=C(C=CC(=C2)S(=O)(=O)[O-])[N+](=C1C=CC=C3C(C4=C(N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)C=CC(=C4)S(=O)(=O)[O-])(C)C)C)C | ||
分子式 | C34H38N3NaO10S2 | 分子量 | 735.80 |
溶解度 | very high in water, good in polar organic solvents (DMF, DMSO) | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。 |
要求 | 為了獲得的溶解度，請將管在37℃加熱并在聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | ||
Spectral properties
光譜信息 大激發(fā)波長 (nm) | 584 | 大發(fā)射波長 (nm) | 563 |
在大激發(fā)波長下的消光系數(shù), Lmol-1cm-1 | 162000 | 熒光量子產(chǎn)率 | 0.1 |
CF260 | 0.03 | CF280 | 0.06 |
產(chǎn)品二 Cy3.5 NHSester （CY3.5,SE）
Cy3.5 NHS ester是一種活性染料，用于標記生物分子中的氨基，Cy3.5®NHS酯的類似物。該試劑是用于標記可溶性蛋白、肽和寡核苷酸/ DNA的試劑。溶解于有機溶劑DMSO，對于微妙的蛋白質(zhì)考慮使用水溶性CY3.5-NHS酯，不需要使用共溶劑。
化學名稱 | Cy3.5 NHS ester | |||||
英文名稱 | 2-((1E,3E)-3-(3-butyl-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)prop-1-en-1-yl)-3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-3-ium | |||||
Canonical SMILES | CC1(C)C2=C3C(C=CC=C3)=CC=C2[N+](CCCCCC(ON4C(CCC4=O)=O)=O)=C1/C=C/C=C5C(C)(C)C6=C(C=CC=C7)C7=CC=C6N\5CCCC | |||||
分子式 | C42H44ClN3O4 | 分子量 | 690.27 | |||
溶解度 | >69.6mg/mL in DMSO | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。 | |||
要求 | 為了獲得的溶解度，請將管在37℃加熱并在聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | |||||
光譜信息 大激發(fā)波長 (nm) | 591 | 大發(fā)射波長 (nm) | 604 | |||
在大激發(fā)波長下的消光系數(shù), Lmol-1cm-1 | 116000 | 熒光量子產(chǎn)率 | 0.35 | |||
CF260 | 0.29 | CF280 | 0.22 | |||
產(chǎn)品三 Cy5 NHSester （CY5,SE）
在過去的幾年中，cy5已經(jīng)成為科學研究和領(lǐng)域的一個的標簽。熒光團在紅色區(qū)域發(fā)射大，其中許多CCD探測器表現(xiàn)出大的靈敏度，熒光明亮。
Cy5 NHS ester 是用于標記肽、蛋白質(zhì)和核苷酸中的氨基的活性染料。這種染料需要少量的有機共溶劑（如DMF或DMSO）用于標記反應。該試劑是可貴的標記的可溶性蛋白以及肽和核苷酸的試劑。該試劑也適用于小分子標記的有機溶劑。對于復雜的目標，如易降解的蛋白質(zhì)，當使用DMF或DMSO是不可取的，考慮使用水溶性Cy5 NHS ester，它不需要共溶劑，并且具有相似的熒光性質(zhì)。
化學名稱 | CY5 NHS | |||||
英文名稱 | (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2E)-3,3-dimethyl-2-[(2E,4E)-5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanoate | |||||
CAS: | 1032678-42-4 | |||||
Canonical SMILES | CC1(C2=CC=CC=C2[N+](=C1C=CC=CC=C3C(C4=CC=CC=C4N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)(C)C)C)C | |||||
分子式 | C36H42ClN3O4 | 分子量 | 616.19 | |||
溶解度 | >31.5mg/mL in DMSO | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。. | |||
要求 | 為了獲得的溶解度，請將管在37℃加熱并在聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | |||||
光譜信息 大激發(fā)波長 (nm) | 646 | 大發(fā)射波長 (nm) | 662 | |||
在大激發(fā)波長下的消光系數(shù), Lmol-1cm-1 | 250000 | 熒光量子產(chǎn)率 | 0.2 | |||
CF260 | 0.03 | CF280 | 0.04 | |||
菁染料Cy3 和Cy5 已成為芯片的熒光標記物; 另外,Cy5, Cy5.5 和Cy7 的吸收在近紅外區(qū)背景低，是熒光度、穩(wěn)定的長波長染料。特別適合于活體小體內(nèi)成像代替放射性元素。下圖是CY5熒光標記小鼠的圖片。
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