【CELL新作】NEPA21助力類器官*Hans Clevers再發(fā)CELL新作!
2009年,Hans Clevers及其團隊成功利用小鼠腸道的成體干細胞培育出了第一個腸道類器官,從而揭開了類器官研究的新篇章。類器官的培養(yǎng)過程涉及成體干細胞(TSCs)或多能干細胞(PSCs)在體外進行3D培養(yǎng),形成具有一定空間結(jié)構(gòu)的組織模擬物,其結(jié)構(gòu)和功能類似于真實器官,這有助于提高藥物研發(fā)的成功率。未來借助AI技術(shù)與類器官的聯(lián)合應(yīng)用,藥物篩選將變得更為高效和精準(zhǔn)。
人類大腦發(fā)育是一個復(fù)雜而精密的過程,不僅與神經(jīng)祖細胞大規(guī)模擴張有關(guān),還需要同時建立一個多細胞組織結(jié)構(gòu)。理論上,不斷擴大的類器官可以直接從多個體組織細胞中生長,但到目前為止,腦類器官只能從多能干細胞中建立。2024年1月,類器官*Hans Clevers教授與Benedetta Artegian教授團隊在CELL上聯(lián)合發(fā)表了“Human fetal brain self-organizes into long-term expanding organoids”一文。該研究直接從人胎兒腦組織中培育出體外自組織的大腦類器官,命名為FeBOs(Fetal brain in vitro self-organizes into organoids)。這種實驗室培養(yǎng)的類器官不僅創(chuàng)立了研究大腦發(fā)育的全新模式,還為深入探討大腦發(fā)育相關(guān)疾病,如腦腫瘤的發(fā)展和治療,提供了有價值的新途徑。
首先,研究人員從人類胎兒腦組織中分離出神經(jīng)干細胞(NSCs),這些細胞以單層或3D細胞聚集物的形式生長;同時,若將組織切成小塊,并在無血清和無細胞外基質(zhì)的培養(yǎng)基中培養(yǎng),也能形成有組織的3D結(jié)構(gòu),稱之為胎兒衍生腦類器官(FeBOs)。超過95%的FeBOs系可通過切割整個類器官樣體進行傳代,每個切割片段都能重新形成完整的類器官樣體,提高了FeBOs系的可重復(fù)性,為下游應(yīng)用提供了穩(wěn)定的擴增。隨后,研究人員利用標(biāo)志基因評估FeBOs的細胞組成,發(fā)現(xiàn)外圍富含神經(jīng)干/祖細胞(SOX2+),而中心則分布神經(jīng)元細胞(TUJ1+, DCX+, NeuN+)。細胞組成定量分析顯示,F(xiàn)eBOs內(nèi)細胞的可再生豐度和異質(zhì)性。通過慢病毒感染完整的FeBOs,研究人員評估了細胞系動力學(xué),發(fā)現(xiàn)標(biāo)記細胞數(shù)量隨時間增加,支持正在進行的神經(jīng)發(fā)生。此外,轉(zhuǎn)錄組分析還揭示了FeBOs的神經(jīng)外胚層特征。
圖1 人胎兒腦自組織類器官的建立
為研究是否能夠培養(yǎng)具有人腦區(qū)域特異性的FeBOs,檢驗其在體外是否能保持內(nèi)在組織特性,研究團隊成功建立了背側(cè)和腹側(cè)FeBOs系,并通過qPCR檢測標(biāo)志物的表達。隨后,免疫熒光表征進一步顯示了FeBOs的區(qū)域特異性,同時單細胞RNA測序分析也進一步揭示了FeBOs與人胎兒腦組織細胞的相似性。
圖2 FeBOs與人胎兒腦組織的細胞相似性
越來越多的證據(jù)表明,細胞外基質(zhì)(ECM)和ECM-細胞相互作用在調(diào)節(jié)人類大腦發(fā)育中的特異性擴張方面起著至關(guān)重要的作用。通過與蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)比較,他們發(fā)現(xiàn)大腦ECM關(guān)鍵成分在轉(zhuǎn)錄組-蛋白質(zhì)組表達上呈現(xiàn)出良好的一致性。分泌蛋白組的結(jié)果顯示,持續(xù)的組織完整性有助于生成ECM生態(tài)位,而ECM生態(tài)位可能反過來促進FeBOs在組織結(jié)構(gòu)中的持續(xù)擴張,使研究人類大腦發(fā)育中的功能性ECM成為可能。
鑒于來源于組織的類器官具備迅速擴張的潛力,研究團隊深入研究了這些類器官在模擬腦癌方面的潛能。在本文中,研究團隊利用NEPA21成功將piggyBac質(zhì)粒、CAG-EGFP質(zhì)粒、sgRNA質(zhì)粒和mCherry-Cas9質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染至人胎兒腦類器官中,實現(xiàn)了FeBOs的熒光標(biāo)記和基因編輯。結(jié)果顯示,經(jīng)過3個月的培養(yǎng),具有TP53基因缺陷的細胞數(shù)量超過了類器官中的健康細胞,表明該FeBOs突變株具備癌細胞異常增殖的特性。這一研究提供了先進的類器官模型,為深入了解大腦發(fā)育和相關(guān)疾病提供有力工具,對神經(jīng)科學(xué)研究和疾病治療具有重要。
圖3 FeBOs支持穩(wěn)定的腫瘤建模
值得關(guān)注的是,腫瘤類器官模型的建立依賴于穩(wěn)定、高效的轉(zhuǎn)染方法。有報告指出,脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑在腸道類器官中的轉(zhuǎn)染效率不足10%。逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)和慢病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)效率較高,但是病毒隨機整合到宿主中具有潛在的誘變性。電穿孔法不僅可以實現(xiàn)類器官60%或更高的轉(zhuǎn)染效率,同時也具備更高的生物安全性。
NEPA21電轉(zhuǎn)染儀是由日本NEPAGENE品牌推出的一款先進的電穿孔設(shè)備,其四步法電轉(zhuǎn)程序極大地提升了類器官轉(zhuǎn)染的效率,使其成為類器官轉(zhuǎn)染領(lǐng)域的解決方案。自2015年起,Hans Clevers教授及其合作團隊便使用NEPA21進行類器官轉(zhuǎn)染,至今已經(jīng)在腸道、肝臟、乳腺組織、子宮內(nèi)膜和大腦等多種組織類器官中成功實現(xiàn)了基因轉(zhuǎn)染及編輯。
NEPA21電穿孔類器官體系及參數(shù)總結(jié)如下:
人胎兒腦類器官
人乳腺組織類器官
人胎兒肝臟類器官
人腸道類器官
圖4 類器官電穿孔基本流程
了解更多類器官電轉(zhuǎn)染實驗操作及參數(shù)設(shè)置或查閱NEPAGENE類器官應(yīng)用文獻:
NEPA21高效基因轉(zhuǎn)染系統(tǒng)采用全新設(shè)計的電轉(zhuǎn)程序,配合電壓衰減設(shè)計,在獲得高轉(zhuǎn)染效率的同時,提高細胞存活率。操作簡單,電轉(zhuǎn)參數(shù)可見可調(diào),適用性強。特別適用于難轉(zhuǎn)染的原代免疫細胞、干細胞、神經(jīng)細胞、外泌體、類器官、活體動物、受精卵及宮內(nèi)胚胎等的轉(zhuǎn)染,已應(yīng)用于眾多著名期刊文獻中,是進行細胞懸浮/貼壁狀態(tài)、活體和離體組織轉(zhuǎn)染的電轉(zhuǎn)系統(tǒng)主流品牌之一。
參考文獻
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