新一代DNA測(cè)序:提高對(duì)肌營(yíng)養(yǎng)不良癥的診斷
諾丁漢大學(xué)的科學(xué)家們運(yùn)用了一種革命性的新DNA讀取技術(shù)以矯正對(duì)肌肉萎縮疾病的基因診斷。這項(xiàng)技術(shù)可以被運(yùn)用在對(duì)肌營(yíng)養(yǎng)不良癥或者有相關(guān)神經(jīng)肌肉癥狀的人進(jìn)行更加準(zhǔn)確的診斷,以此幫助患者了解病況并對(duì)其生活,包括生育計(jì)劃做出更明智的選擇。
研究者們利用新一代的DNA測(cè)序儀器檢查以前被錯(cuò)誤診斷為其他肌營(yíng)養(yǎng)不良癥種類(lèi)的病人。
由諾丁漢大學(xué)生物學(xué)院Jane Hewitt教授指導(dǎo)的研究獲得了肌營(yíng)養(yǎng)不良癥運(yùn)動(dòng)的贊助,以Andreas Leidenroth的博士研究助學(xué)金方式。Andreas說(shuō):“我們的案例研究展現(xiàn)了將來(lái)的基因診斷該如何進(jìn)行。新的DNA測(cè)序儀將會(huì)是人們負(fù)擔(dān)得起的,容易操作的,適合放置在辦公桌上的儀器。它將在幾分鐘內(nèi)就解碼整個(gè)人類(lèi)基因組。高通量DNA測(cè)序在英國(guó)國(guó)家衛(wèi)生服務(wù)部門(mén)(NHS)來(lái)說(shuō)不再是一個(gè)是否可能的想法,而是何時(shí)得以實(shí)施。zui大的挑戰(zhàn)將是建立標(biāo)準(zhǔn)的過(guò)濾準(zhǔn)則以便我們可以很容易地從DNA大型數(shù)據(jù)庫(kù)中提取相關(guān)信息。
發(fā)表在《歐洲人類(lèi)遺傳學(xué)期刊》上的研究著重在被診斷為面肩肱型肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(FSHD)的人。這是一種主要影響面部,肩部和上臂肌肉的肌營(yíng)養(yǎng)不良癥。然而,科學(xué)家們研究發(fā)現(xiàn)的好幾處不一致說(shuō)明這位患者很可能并沒(méi)有患上面肩肱型肌營(yíng)養(yǎng)不良癥。
為了得到一個(gè)基因診斷,通常是針對(duì)與肌營(yíng)養(yǎng)不良癥有關(guān)的基因逐一進(jìn)行測(cè)試。這是一個(gè)費(fèi)時(shí)費(fèi)力的過(guò)程。而且這個(gè)過(guò)程只限于少量的基因,而可能會(huì)錯(cuò)失突變的基因。諾丁漢大學(xué)研究小組采用了整個(gè)基因測(cè)序,而不是一次讀一個(gè)單一的基因代碼,同時(shí)破譯人類(lèi)基因組的超過(guò)25,000個(gè)基因。這個(gè)保證不遺漏對(duì)突變基因?qū)彶闄C(jī)會(huì)的優(yōu)勢(shì),同時(shí)也帶來(lái)了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn):每個(gè)人的DNA都不用,我們?cè)趺茨苤滥男┦怯泻Φ?,而不是一種無(wú)害的只是*于攜帶者的基因呢?
科學(xué)家們利用不同的數(shù)據(jù)過(guò)濾器小心翼翼地進(jìn)行篩選。首先,他們跳過(guò)所有的在健康人體上發(fā)現(xiàn)的有著細(xì)微排序差別的DNA,假設(shè)它們是無(wú)害的。在950個(gè)不同種有450個(gè)基因看上去是有害的突變基因。當(dāng)科學(xué)家們將450個(gè)縮減到30個(gè)已知肌營(yíng)養(yǎng)不良癥基因,他們發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)配對(duì):病人有兩個(gè)已知的會(huì)導(dǎo)致肢帶型肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(LGMD)2A型的突變基因,因而糾正了這名病人的被誤診為面肩肱型肌營(yíng)養(yǎng)不良癥的診斷。
鑒于肌營(yíng)養(yǎng)不良癥的復(fù)雜性,超過(guò)20%的患者目前沒(méi)有得到基因診斷,英國(guó)的一萬(wàn)名患者沒(méi)有關(guān)于他們病情進(jìn)展的準(zhǔn)確信息。治療迫在眉睫,但前提是要得到正確的診斷。
研究證明新一代的基因測(cè)序作為診斷工具的重要性。像NHS的醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)在不久的將來(lái)很可能采取類(lèi)似的技術(shù)。這些方法將持續(xù)發(fā)展,類(lèi)似這樣的案例研究將對(duì)其他研究者提供重要的指導(dǎo)意義,并證明其可行性。
肌肉萎縮癥運(yùn)動(dòng)研究中心主任 Marita Pohlschmidt博士說(shuō):“會(huì)診神經(jīng)肌肉疾病是非常不容易的。當(dāng)前英國(guó)成千上萬(wàn)的人得不到關(guān)于他們病情的確定的診斷結(jié)果。這不僅造成心理上的問(wèn)題,還會(huì)對(duì)人們的生活產(chǎn)生嚴(yán)重影響,對(duì)他們的人生規(guī)劃和生育計(jì)劃造成困擾。這項(xiàng)研究是非常有前途,給許多家庭帶來(lái)了希望。”
諾丁漢大學(xué)研究者與挪威在奧斯陸的高通量測(cè)序中心同事合作,由諾丁漢羅伯特的資金建設(shè)經(jīng)驗(yàn)和技能旅行獎(jiǎng)學(xué)金(BESTS)贊助。
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