siRNA轉(zhuǎn)染的常見(jiàn)問(wèn)題解答
siRNA轉(zhuǎn)染的常見(jiàn)問(wèn)題解答
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如何優(yōu)化siRNA轉(zhuǎn)染?轉(zhuǎn)染少量的siRNA為何很重要?在siRNA轉(zhuǎn)染過(guò)程中為何應(yīng)當(dāng)避免細(xì)胞毒性?本文收錄了與siRNA轉(zhuǎn)染相關(guān)的常見(jiàn)問(wèn)題,并附上專家的解答,希望能對(duì)您的實(shí)驗(yàn)有幫助。
Q:我該如何優(yōu)化siRNA轉(zhuǎn)染?
A:在實(shí)驗(yàn)室中建立RNAi和研究每一種新的細(xì)胞系時(shí),應(yīng)當(dāng)優(yōu)化siRNA的轉(zhuǎn)染。HiPerFect Transfection Reagent Handbook中包含優(yōu)化的有用信息(www.qiagen.com/HB/HiPerFect)。在優(yōu)化實(shí)驗(yàn)中,轉(zhuǎn)染效率可通過(guò)陽(yáng)性對(duì)照(如AllStars Cell Death Control siRNA)的轉(zhuǎn)染來(lái)監(jiān)控。應(yīng)當(dāng)優(yōu)化的轉(zhuǎn)染因素包括:
試劑和siRNA的量
轉(zhuǎn)染時(shí)的細(xì)胞匯合度
分析前細(xì)胞和復(fù)合物的孵育時(shí)間
Q:轉(zhuǎn)染少量的siRNA為何很重要?
A:高濃度的siRNA轉(zhuǎn)染可能產(chǎn)生脫靶效應(yīng),即siRNA影響了部分同源或非同源基因的表達(dá)。研究表明,可能會(huì)對(duì)RNAi實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生誤導(dǎo)結(jié)果的脫靶效應(yīng)可通過(guò)降低siRNA濃度而在很大程度上避免(1,2)。HiPerFect Transfection Reagent有助于siRNA的吸收,實(shí)現(xiàn)了低濃度下的基因沉默,而不損害knockdown的效率。
Q:在siRNA轉(zhuǎn)染過(guò)程中為何應(yīng)當(dāng)避免細(xì)胞毒性?
A:siRNA導(dǎo)入所引起的細(xì)胞毒性干擾了RNAi后的數(shù)據(jù)分析,因?yàn)楸硇头治霾辉倏煽?。影響?shù)據(jù)分析的因素包括轉(zhuǎn)染試劑所引起的表型改變,壓力所引起的基因表達(dá)改變,以及不應(yīng)當(dāng)用于分析的死細(xì)胞的存在。
HiPerFect Transfection Reagent對(duì)細(xì)胞無(wú)毒性,不會(huì)引起液泡形成(這標(biāo)志著細(xì)胞進(jìn)程的破壞)。詳細(xì)的細(xì)胞周期和細(xì)胞形態(tài)學(xué)分析顯示mock轉(zhuǎn)染的細(xì)胞(只有HiPerFect Transfection Reagent)和未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞之間無(wú)差異。
Q:順式轉(zhuǎn)染和反式轉(zhuǎn)染之間有什么差別?
A:在反式轉(zhuǎn)染的步驟中,siRNA先加在平板的孔中,然后才是轉(zhuǎn)染試劑。在復(fù)合物形成之后,加入細(xì)胞。順式轉(zhuǎn)染則相反,先在孔中加入細(xì)胞,然后才是復(fù)合物。反式轉(zhuǎn)染使用廣泛,特別對(duì)于高通量實(shí)驗(yàn),因?yàn)樗菀鬃詣?dòng)化,轉(zhuǎn)染前siRNA可儲(chǔ)存在孔中,且使用了較少的材料,因?yàn)椴恍枰谝粔K單獨(dú)的板上開(kāi)展siRNA-轉(zhuǎn)染試劑復(fù)合物的形成。
順式轉(zhuǎn)染 反式轉(zhuǎn)染
第1步 細(xì)胞 第1步 核酸
第2步 轉(zhuǎn)染復(fù)合物 第2步 HiPerFect Reagent
第3步 細(xì)胞
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