單外泌體表征分析技術(shù)2022年Nano Letters盤點
外泌體是包含了復(fù)雜RNA和蛋白質(zhì)的小膜泡,是細胞間信號傳輸?shù)妮d體。多種細胞在正常及病理狀態(tài)下均可分泌外泌體,它們廣泛存在于血液、唾液、尿液、腦脊液和乳汁等體液中,參與細胞間通訊。近年來,外泌體的研究熱度持續(xù)攀升,在2019年國家自然科學(xué)基金獲批項目中,外泌體研究相關(guān)項目的總數(shù)突破500個,立項的總金額突破2億元。但由于外泌體的尺寸(30~200 nm),常規(guī)的光學(xué)顯微鏡無法對其進行成像分析,因此很少有技術(shù)能夠?qū)蝹€外泌體進行物理表征和蛋白分型。
美國NanoView Biosciences公司推出了全自動外泌體熒光檢測分析系統(tǒng)ExoView,系統(tǒng)采用了創(chuàng)新的SP-IRIS成像技術(shù),只需要少量樣品即可一次完成外泌體計數(shù)、粒徑、蛋白表達、蛋白共定位、亞群分布的分析。全自動外泌體熒光檢測分析系統(tǒng)ExoView于2018年被推出后,便引起了外泌體領(lǐng)域科研工作者的廣泛關(guān)注,目前在全球已近100多個實驗室采用該技術(shù),發(fā)表文獻超過170篇。進入2022年,使用ExoView發(fā)表的論文出現(xiàn)井噴性增長,短短數(shù)月已經(jīng)發(fā)表了超過75篇。本文選取了兩篇在高水平期刊《Nano Letters》發(fā)表的比較有代表性的文章,來說明ExoView在間充質(zhì)干細胞(MSC)、單外泌體亞群分析等研究領(lǐng)域的具體應(yīng)用。
三維培養(yǎng)的MSC外泌體-水凝膠混合微針陣列貼片用于脊髓修復(fù)
脊髓損傷(SCI)是脊柱損傷最嚴(yán)重的并發(fā)癥,是人類健康最嚴(yán)重的威脅之一。早先研究已證明間充質(zhì)干細胞(MSC)來源的外泌體在SCI治療中方面具有巨大的應(yīng)用潛力。然而,傳統(tǒng)的二維(2D)培養(yǎng)模式會導(dǎo)致間充質(zhì)干細胞的干細胞特性喪失,從而影響間充質(zhì)干細胞來源的外泌體(2D-Exo)的治療性能。三維培養(yǎng)模式產(chǎn)生的外泌體(3D-Exo)具有更高的治療效率,因此其在脊髓治療中也有著更為廣泛的應(yīng)用,但之前的相關(guān)報道極少。另外,傳統(tǒng)的外泌體治療通常依賴于局部的反復(fù)注射,遺憾的是這種方法由于清除速率很快導(dǎo)致治療效率低下,并且也可能會導(dǎo)致對脊髓的二次損傷。因此,開發(fā)一種更加可靠、方便和有效的外泌體遞送方法,以實現(xiàn)穩(wěn)定的原位外泌體釋放成為新的研究方向。近日,韓敏等[1]開發(fā)了一種可控的3D外泌體水凝膠混合微針陣列貼片以實現(xiàn)SCI原位修復(fù)。
其中,研究人員使用甲基丙烯?;髂z(GelMA)混合3D培養(yǎng)的MSC來源的外泌體構(gòu)建了用于微針陣列貼片,并用ExoView對2D-Exo和3D-Exo進行了檢測。2D-Exo和3D-Exo的亞群計數(shù)結(jié)果顯示,具有CD81+或(和)CD9+跨膜蛋白的外泌體數(shù)量最多(圖1 A和B)。2D-Exo和3D-Exo的熒光強度分布如圖1 C和D所示。熒光共定位分析結(jié)果顯示3D-Exo富含同時表達CD81+CD9+的外泌體(圖1 E、F、G、H)。此外,MSC-Exo粒徑的統(tǒng)計分析表明,2D-Exo的CD9+外泌體的平均粒徑為67±22nm,2D-Exo的CD81+外泌體的平均粒徑為70±25nm(圖1 I和J),3D-Exo的CD9+外泌體的平均粒徑為60±15nm,3D-Exo的CD81+外泌體的平均粒徑為59±14 nm(圖1 K和L)??傮w而言,3D-Exo粒徑更小,更容易被靶細胞吞噬。熒光成像結(jié)果顯示,3D-Exo中CD81和CD9的熒光強度顯著高于2D-Exo(圖1 M和N )。
圖1 ExoView檢測2D-Exo和3D-Exo的亞群數(shù)量、熒光強度、共定位、粒徑分布以及進行熒光成像
超靈敏的高通量液滴數(shù)字酶聯(lián)免疫吸附法檢測單外泌體
由于外泌體在診斷和治療領(lǐng)域具有巨大潛力,因此單外泌體水平檢測一直是研究熱點。目前大多數(shù)的外泌體分析技術(shù)主要基于成像,但是較多成像技術(shù)檢測的粒子數(shù)量級有限,很難實現(xiàn)臨床樣本的高通量檢測(大于108 EV/ml)。此外,單一平臺實現(xiàn)檢測靈敏度達到單外泌體水平、區(qū)分外泌體的不同亞群特異性以及高通量分析非常具有挑戰(zhàn)性。近期Zijian Yang等[2]發(fā)明了一種高通量數(shù)字測定法,這是一種基于液滴可以對特定的單外泌體亞群進行高通量量化分析的光流控平臺(DEVA)。
其中,研究人員使用ExoView對來源于人類神經(jīng)元的外泌體進行分析,對開發(fā)的DEVA系統(tǒng)進行評估。ExoView可以通過免疫捕獲和熒光標(biāo)記對外泌體進行分析,紅色熒光抗體代表CD63,綠色熒光抗體代表CD81,藍色熒光抗體代表CD9(圖2 A和B)。亞群計數(shù)結(jié)果顯示CD81+外泌體數(shù)量顯著高于CD63+或CD9+外泌體(p<0.05,p<0.0001),也顯著高于MIgG陰性對照(p<0.0001)(圖2 C)。CD81+外泌體的熒光共定位分析顯示每個標(biāo)記組代表一個不同的外泌體亞群,互相沒有交集,其中只標(biāo)記CD81熒光抗體的外泌體數(shù)量最多,其次是只標(biāo)記CD63熒光抗體和同時標(biāo)記CD63CD81熒光抗體的外泌體(圖2 D)。另外,在CD81+外泌體中,67% (64.3%-69.8%) 的外泌體同時共表達了另一個CD81蛋白(熒光標(biāo)記)(圖2 E)。因此,研究人員選擇使用CD81進行捕獲和標(biāo)記,而不是使用神經(jīng)元特定的表面蛋白標(biāo)記物,這樣能夠量化和校準(zhǔn)DEVA的性能。
圖2 ExoView的原理示意圖以及ExoView檢測人類神經(jīng)元的外泌體的亞群數(shù)量、共定位和進行熒光成像
在上述兩篇文章中,科學(xué)家借助美國NanoView Biosciences公司研發(fā)的全自動外泌體熒光檢測分析系統(tǒng)ExoView,直接檢測樣本中的外泌體,無需純化,操作簡單。一次結(jié)果直接輸出外泌體粒徑,絕對數(shù)目,蛋白表型,不同亞群的含量、多色熒光成像圖。兩篇文章分別從間充質(zhì)干細胞(MSC)、單外泌體亞群分析等研究領(lǐng)域介紹了ExoView的無需純化,全面表征的特點,有力地證明ExoView是外泌體檢測的一大利器。
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參考文獻:
[1] Min Han ……& Tao Xin. (2022) Three-Dimensional-Cultured MSC-Derived Exosome-Hydrogel Hybrid Microneedle Array Patch for Spinal Cord Repair. Nano Letters, 22, 15: 6391–6401.
[2] Zijian Yang ……& David A. Issadore. (2022) Ultrasensitive Single Extracellular Vesicle Detection Using High Throughput Droplet Digital Enzyme-Linked Immunosorbent Assay. Nano Letters, 22, 11: 4315–4324.
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