如何應(yīng)對細(xì)胞株系開發(fā)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)
細(xì)胞株開發(fā)是眾多具有重大數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)的工作流程之一。與任何篩選過程一樣,樣本通量帶來了數(shù)據(jù)量的挑戰(zhàn)。當(dāng)使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數(shù)據(jù)時,這就變得更加具有挑戰(zhàn)性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數(shù)據(jù),而且整個過程可能會延長數(shù)月。在整個過程中,必須對數(shù)據(jù)進行追蹤,以確保進入生產(chǎn)的任何細(xì)胞株都有必要的歷史數(shù)據(jù)(例如單克隆性的證明),并且為了報告需要,所有的數(shù)據(jù)都可以被方便地訪問。在這里,我們將描述在Biomek i7工作站(圖1)上自動化細(xì)胞株開發(fā)如何克服與此工作流程相關(guān)的許多數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)。
圖1:Biomek i7工作站與三方設(shè)備整合一起被用于自動化細(xì)胞株開發(fā)工作流程。
作為液體轉(zhuǎn)移步驟的一部分,Biomek軟件會自動移動數(shù)據(jù),因此數(shù)據(jù)可以隨著樣本移動而并行移動(圖4)。同時,數(shù)據(jù)也可以存儲在DART數(shù)據(jù)庫中,未來任何時候掃描孔板條碼時,相應(yīng)的數(shù)據(jù)都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接(圖4)——在諸如細(xì)胞株開發(fā)這樣的長時間工作流程中,這是一個關(guān)鍵組件。
圖3:自動化數(shù)據(jù)處理示意圖。
除開存儲和利用數(shù)據(jù),DART數(shù)據(jù)庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進行快速可視化,可通過Chrome瀏覽器直接實時查看(圖6A),同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。
圖6:DART數(shù)據(jù)查看和報告。
在任何實驗中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)使實驗有價值。數(shù)據(jù)處理中的任何錯誤都可能消除這個價值,甚至可能將研究進程推向錯誤的方向。對于像細(xì)胞株開發(fā)這樣長達數(shù)月的工作流程,數(shù)據(jù)丟失或錯誤的風(fēng)險更大,因此,確保數(shù)據(jù)完整性的工具至關(guān)重要。Biomek和DART軟件通過使數(shù)據(jù)完整性過程自動化且易于獲取,可以為細(xì)胞株開發(fā)過程提供真正的價值。
想要了解更多關(guān)于數(shù)據(jù)處理方面的內(nèi)容,請點擊下圖訪問貝克曼庫爾特生命科學(xué)部官|(zhì)網(wǎng)
*以上內(nèi)容涉及設(shè)備僅適用于科研和工業(yè),不用于臨床診斷。
相關(guān)產(chǎn)品
免責(zé)聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。