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大分子蛋白質(zhì)失穩(wěn)原因和研究方法
蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性指的是蛋白質(zhì)抵抗各種因素的影響,保持其生物活力的能力。蛋白質(zhì)在細(xì)胞和生物體的生命活動(dòng)過程中,起著十分重要的作用。從生物的構(gòu)成到生物的新陳代謝、遺傳都和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能密切相關(guān)。生物的結(jié)構(gòu)和性狀都與蛋白質(zhì)有關(guān)。因此,合適的表征手段對(duì)研究蛋白質(zhì)變性至關(guān)重要。
一、蛋白質(zhì)失活的原因和機(jī)理:
1蛋白水解酶和自溶作用
1.1酶在使用和貯存過程中的失活常是由于微生物和外源蛋白水解酶作用的結(jié)果。蛋白水解酶可催化肽鍵水解。
1.2 當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)底物也是一種蛋白水解酶時(shí),就會(huì)發(fā)生自我降解現(xiàn)象,叫做自溶。
2 聚合作用
蛋白質(zhì)發(fā)生可逆性伸展——>伸展的蛋白質(zhì)分子彼此締合——>可能發(fā)生蛋白質(zhì)分子間二硫鍵的形成從而使蛋白質(zhì)沉淀析出。蛋白質(zhì)的聚合作用和沉淀的區(qū)別:蛋白質(zhì)的聚合作用可能是可逆的,并不一定是不可逆的。沉淀作用意味著蛋白質(zhì)并未發(fā)生顯著的構(gòu)象變化即從溶液中析出。因此沉淀很容易再溶于水溶液宏,并恢復(fù)其全部天然特性。
3 pH
pH下引起蛋白質(zhì)變性的重要因素是:一旦遠(yuǎn)離了蛋白質(zhì)的等電點(diǎn),那么蛋白質(zhì)分子內(nèi)相同電荷間的靜電斥力會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)伸展。從而使埋藏在蛋白質(zhì)內(nèi)部非電離殘基發(fā)生電離,導(dǎo)致失活。pH的變化可以引起蛋白質(zhì)的伸展,這個(gè)過程原則上是可逆的,但這些變化常能導(dǎo)致不可逆的聚合或酶的自溶,引起不可逆失活。
4 氧化作用
各種氧化劑能氧化帶芳香族側(cè)鏈的氨基酸以及蛋氨酸、半胱氨酸和胱氨酸殘基,從而使蛋白質(zhì)變性。分子氧,H2O2和氧自由基是常見的蛋白質(zhì)氧化劑。
5 表面活性劑和去污劑
表面活性劑在很低濃度下能使蛋白質(zhì)發(fā)生強(qiáng)烈地相互作用,導(dǎo)致蛋白質(zhì)不可逆變性。其中陰離子去污劑的作用比陽離子和非離子去污劑強(qiáng)烈。
6 變性劑
6.1脲和鹽酸胍:機(jī)制尚不明確,可能是消除了維持三級(jí)結(jié)構(gòu)的疏水作用力或直接與蛋白質(zhì)分子作用
6.2高濃度鹽:高濃度鹽既有穩(wěn)定作用也有變性作用,這要看鹽的性質(zhì)和濃度。
6.3螯合:常常不可逆地失活需要金屬輔因子的酶,但可穩(wěn)定不需要金屬輔因子的酶。
6.4有機(jī)溶劑改變?nèi)芤旱慕殡姵?shù);增加疏水核的溶解度,降低帶電表面的溶解度;奪去酶分子表面的必須水而使酶失活。
7 重金屬離子和疏基試劑
與蛋白質(zhì)的疏基、二硫鍵以及色氨酸、組氨酸殘基反應(yīng)。
8 熱
熱失活是溶液上經(jīng)常遇到的酶失活的原因。熱失活分兩部分:伸展---不可逆失活。
9 機(jī)械力
振動(dòng)、剪切、超聲波、壓力都可能引起蛋白質(zhì)的變性。這種變性理論上是可逆的,但也伴隨著其他反應(yīng)而不可逆地失活。
10 冷凍和脫水
冷凍和脫水時(shí),溶質(zhì)被濃縮,引起酶微環(huán)境中pH和離子強(qiáng)度的劇烈改變,減弱疏水相互作用,并可能引起二硫交換和疏基的氧化。
11 輻射作用:
輻射可產(chǎn)生自由基(·OH,H2O2,O2-等)直接或間接地作用于蛋白質(zhì)分子。
二、蛋白質(zhì)失活的研究方法
案例1 組氨酸對(duì)蛋白的保護(hù)作用
Turbiscan多重光散射儀(靜態(tài)多重光散射)
用Turbiscan多重光散射儀測(cè)量高濃度蛋白溶液中的平均粒徑來監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)的聚集。該技術(shù)分析了蛋白質(zhì)的自然形態(tài)與時(shí)間的關(guān)系,且無需稀釋。10 wt%濃度的牛血清白蛋白蛋白(BSA)分散于水中,在60℃下分析20h。
蛋白粒徑與組氨酸含量的關(guān)系(左:粒徑vs時(shí)間 右:粒徑@20hvs組氨酸濃度)
討論:增加組氨酸濃度可使蛋白直徑保持較低且更接近其原始狀態(tài)而不發(fā)生變性。多重光散射技術(shù)測(cè)量過程無需稀釋,可以在原位狀態(tài)下表征蛋白質(zhì)的聚集變性過程,是比較科學(xué)的研究失穩(wěn)過程的方法。
案例2 輻射對(duì)蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的影響
2018年Chengliang Li等學(xué)者利用Turbscan(靜態(tài)多重光散射)研究了輻射對(duì)SP肌漿蛋白和MP肌肉蛋白的物理穩(wěn)定性的影響。不同輻照劑量0, 3, 5 and 7 kGy的TSI不穩(wěn)定性指數(shù)在3h內(nèi)的變化曲線如下圖所示。
TSI穩(wěn)定性指數(shù)隨時(shí)間變化關(guān)系(左:MP肌肉蛋白 右:SP肌漿蛋白)
為了表征蛋白質(zhì)失穩(wěn)過程的彈性和粘性性變化,Chengliang Li利用Rheolaser Master(動(dòng)態(tài)多重光散射)評(píng)價(jià)了不同輻射劑量蛋白的微流變性。
Rheolaser Master光學(xué)法微流變儀
微流變性隨時(shí)間變化關(guān)系(A MP肌肉蛋白彈性 B SP肌漿蛋白彈性 C MP肌肉蛋白粘性 D SP肌漿蛋白粘性)
討論:對(duì)于MP肌肉蛋白而言,輻射劑量≥5kgy時(shí)的TSI高于輻射劑量3kgy的TSI,但是差距不大,MP的物理穩(wěn)定性隨輻射劑量變化不明顯。這與微流變數(shù)據(jù)(A和C)有比較好的對(duì)應(yīng)關(guān)系。另外,與SP對(duì)照組相比,輻射后的SP樣品的TSI顯著升高,說明SP可能聚集并形成蛋白質(zhì)聚合物
Li C , He L , Ma S , et al. Effect of irradiation modification on conformation and gelation properties of pork myofibrillar and sarcoplasmic protein[J]. Food Hydrocolloids, 2018, 84(NOV.):181-192.
案例3 Rheolaser Crystal表征BSA蛋白的熱穩(wěn)定性
Rheolaser Crystal相變分析儀
熱分析是表征蛋白熱穩(wěn)定性的基本方法之一,多年以來一直廣泛應(yīng)用于科研和工業(yè)中。近年來在各個(gè)領(lǐng)域,特別是高分子材料領(lǐng)域,都有了長(zhǎng)足發(fā)展。差示掃描量熱法(DSC)是應(yīng)用廣泛的熱分析技術(shù)之一。相變分析儀(Rheolaser Crystal)與DSC應(yīng)用方向類似,可以表征蛋白質(zhì)的凝膠點(diǎn),但是由于相變分析儀采用DWS技術(shù),直接從顆粒的納米級(jí)運(yùn)動(dòng)速度獲取數(shù)據(jù),因此對(duì)于結(jié)構(gòu)變化具有更加靈敏的相應(yīng)。
蛋白受熱變性性示意圖
下圖展示了用Rheolaser Crystal與DSC測(cè)量的2%BSA pH 4, 15mM NaCl水溶液的凝膠點(diǎn)。
BSA蛋白的在升溫過程中的凝膠點(diǎn)(藍(lán)色:相變分析儀數(shù)據(jù) 黑色:DSC數(shù)據(jù))
討論:兩個(gè)測(cè)試技術(shù)的凝膠點(diǎn)基本一致。DSC由于基線并不平整,熱的流量曲線在凝膠點(diǎn)附近出現(xiàn)的峰比較小,容易被忽略。而Rheolaser Crystal的峰非常清晰明了地指示了BSA的凝膠點(diǎn),由于測(cè)量方法的優(yōu)勢(shì),Rheolaser Crystal不需要考慮樣品的狀態(tài)固體,粉末,液體,對(duì)樣品制樣要求不高,樣品量多少對(duì)測(cè)試結(jié)果影響不大。
結(jié)論:多重光散射技術(shù)是一種非??煽康谋碚鞯鞍踪|(zhì)失穩(wěn)過程的儀器,采用靜態(tài)多重光散射技術(shù)的Turbiscan適合測(cè)量蛋白在原位狀態(tài)下的粒徑/微觀結(jié)構(gòu)變化過程;采用動(dòng)態(tài)多重光散射技術(shù)的Rheolaser Master和Rheolaser Crystal分別用于表征蛋白變質(zhì)過程中的粘彈性變化過程和蛋白熱穩(wěn)定性。
結(jié)晶分析儀 Rheolaser Crystal
Rheolaser Crystal用于研究樣品微觀結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變過程,儀器基于先進(jìn)的微流變學(xué)原理對(duì)樣品進(jìn)行熱力學(xué)分析,監(jiān)測(cè)所有物理現(xiàn)象:結(jié)晶、融化、多晶形態(tài)轉(zhuǎn)變等。Rheolaser Crystal與Rheolaser Master類似,同樣采用DWS多散斑擴(kuò)散光譜學(xué)。入射的激光被樣品中的顆粒散射,產(chǎn)生干涉,利用高速攝像機(jī)捕捉散斑圖像。散斑圖像變換的速度直接與顆粒的運(yùn)動(dòng)速度相關(guān),顆粒運(yùn)動(dòng)越快,散斑變化速度越快。