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貨物所在地:北京北京市
更新時(shí)間:2023-12-14 08:52:50
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T4 DNA Ligase(Fast)
產(chǎn)品貨號(hào):T5205-200U
儲(chǔ)存條件:-20℃
產(chǎn)品組成
組分 | 規(guī)格 |
T4 DNA Ligase(Fast)(5U/ul) | 40ul |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 1ml |
50% PEG | 1ml |
注:1U=1 Weiss unit
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
T4 DNA Ligase(Fast)由攜帶T4噬菌體gene30的大腸桿菌產(chǎn)生。該酶催化雙螺旋DNA或RNA之間的5'-磷酸基團(tuán)和3'-羥基之間形成磷酸二酯鍵。該酶在雙鏈DNA、RNA或者DNA/RNA復(fù)合物間可修復(fù)單鏈缺刻,并且可以連接有粘性末端或者平末端的DNA片段,但對(duì)于單鏈核酸無(wú)活性,主要用于限制性?xún)?nèi)切酶酶切產(chǎn)物DNA片段克隆、基因定點(diǎn)突變與PCR產(chǎn)物克隆、修復(fù)雙鏈DNA缺刻與線性DNA自環(huán)化。T4 DNA Ligase(Fast)需要ATP作為輔助因子,在室溫下完成粘性末端連接反應(yīng)僅需10分鐘。
酶活單位定義
37℃條件下,1 Weiss unit的酶在20min內(nèi)催化1nmol的[PPi]轉(zhuǎn)變?yōu)榛钚蕴课綉B(tài)。1 Weiss unit等同于約200個(gè)粘性末端連接反應(yīng)單位(CEU),相當(dāng)于在16℃條件下,30min內(nèi)連接50% HindIII消化后的λDNA片段。
酶活檢測(cè)條件
酶活在如下反應(yīng)混合物中進(jìn)行測(cè)試:66mM Tris-HCl(pH7.6),6.6mM MgCl,0.066mM ATP,10mM DTT,3.3μM[32PPi]。
質(zhì)量控制
核酸量?jī)?nèi)控切酶制殘留測(cè)試
37℃條件下,將200U的T4 DNA Ligase(Fast)與1ug的pUC19DNA中溫育4h,未檢測(cè)出共價(jià)閉合環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變?yōu)閹в腥笨痰腄NA。
核酸外切酶殘留檢測(cè)
將酶液與雙鏈DNA底物在37℃溫育16h,通過(guò)DNA電泳檢測(cè)雙鏈DNA底物無(wú)變化。
藍(lán)白斑測(cè)試
室溫條件下,使用30U T4 DNA Ligase連接pUC57 DNA/HindIII,pUC57 DNA/PstI或pUC57 DNA/SmaI消化產(chǎn)物1h,然后用E.coli XL1-Blue感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化連接產(chǎn)物,檢測(cè)到少于1%的白斑。
使用方法
1.DNA插入片段連接至載體DNA(粘性末端連接)
1)于冰上配制如下反應(yīng)體系:
試劑 | 使用量 |
線性化載體DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:載體摩爾比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 1U(0.2ul) |
Nuclease-FreeWater | To 20ul |
2)充分混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)取1~5ul的連接產(chǎn)物用于50ul化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化,或者取1~2ul用于50ul電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
注:如果連接反應(yīng)產(chǎn)物用于電轉(zhuǎn)化,應(yīng)使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
2.DNA插入片段連接至載體DNA(平末端連接)
1)于冰上配制如下反應(yīng)體系:
試劑 | 使用量 |
線性化載體DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:載體摩爾比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)充分混勻并瞬離,22℃溫育1h;
3)取1~5ul的連接產(chǎn)物用于50ul化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化,或者取1~2ul用于50ul電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
注:如果連接反應(yīng)產(chǎn)物用于電轉(zhuǎn)化,應(yīng)使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
1. 線性DNA自環(huán)化
1)于冰上配制如下反應(yīng)體系:
試劑 | 使用量 |
線性化DNA | 10~50ng |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 5ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 50ul |
2)徹di混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)取1~5ul的連接產(chǎn)物用于50ul化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化,或者取1~2ul用于50ul電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
注:如果連接反應(yīng)產(chǎn)物用于電轉(zhuǎn)化,應(yīng)使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
2.接頭連接
雙鏈寡核苷酸接頭經(jīng)常被用于在插入片段上產(chǎn)生粘性末端。接頭通常包含限制酶識(shí)別位點(diǎn),在連接后經(jīng)酶切處理產(chǎn)生和克隆載體匹配的粘端。有時(shí)候接頭已包含與克隆載體匹配的粘端,此時(shí)無(wú)需在接頭連接完成后進(jìn)行插入片段的進(jìn)一步處理。
1)于冰上配制如下反應(yīng)體系:
試劑 | 使用量 |
線性化DNA | 100~500ng |
磷酸化接頭 | 1~2ug |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 2U(0.4ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)徹di混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)在65℃作用10min或者70℃作用5min,進(jìn)行熱失活。
注:添加1mM ATP的條件下,T4 DNA Ligase(Fast)在LabFD™酶切緩沖液中具有100%活性。因此,接頭連接反應(yīng)時(shí)可以在LabFD™酶切緩沖液中進(jìn)行,以簡(jiǎn)化“接頭連接-酶切"實(shí)驗(yàn)流程。具體方法為:接頭連接反應(yīng)完成后,先失活T4 DNA Ligase,然后向該體系中添加ATP至終濃度1mM,再在體系中加入適量的LabFD™快速內(nèi)切酶,最后使用最適酶切反應(yīng)溫度進(jìn)行溫育即可。
注意事項(xiàng)
1)T4 DNA Ligase在濃度高于200mM的NaCl或KCl中會(huì)被強(qiáng)烈抑制;
2)連接反應(yīng)液添加量不應(yīng)該超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞體積的10%,不推薦體系中加入過(guò)量的T4 DNA Ligase;
3)與T4 DNA Ligase結(jié)合的DNA可能會(huì)在瓊脂糖凝膠中出現(xiàn)帶移或彌散,為了避免此現(xiàn)象,可以在上樣前對(duì)酶進(jìn)行熱失活,必要時(shí)加入適量的SDS;
4)聚乙二醇(PEG)能極大地提高平末端連接的連接效率,PEG8000的推薦添加量是連接體系的5%(w/v);
5)電轉(zhuǎn)化效率可能通過(guò)對(duì)T4 DNA Ligase熱失活或者使用離心柱或者氯仿抽提純化DNA方式來(lái)提高;
6)轉(zhuǎn)化子數(shù)目可通過(guò)延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間至1h而增加。
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