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產品貨號:F5601s
儲存條件:-20℃
同裂酶:Alw44I, VneI
注:同裂酶對于不同的甲基化修飾也許具有不同敏感性。
產品組成
組分 | 規(guī)格 |
LabFD™ ApaLI | 200ul |
10×LabFD™ Buffer | 2x1ml |
10×LabFD™ Color Buffer | 2x1ml |
產品簡介
LabFD™快速內切酶是一系列經過基因工程重組、能夠在5~15分鐘內精確完成DNA切割的高保真限制性內切酶,適用于質粒DNA、PCR產物或基因組DNA等的快速酶切。LabFD™快速內切酶具有如下特點:5~15分鐘內即可完成酶切;共用一種酶切Buffer,大大簡化酶切反應體系;良好的酶活冗余度,輕松應對底物過量或困難模板酶切。此外,LABLEAD去磷酸化、連接試劑在LabFD™酶切Buffer中具有百分之bai活性,支持一管化反應,提升“酶切-修飾-連接"的體驗。
建議反應條件
1×LabFD™緩沖液;
37℃溫育;
參照“DNA快速酶切流程"配制反應體系。
失活條件
80℃溫育20min。
質量控制
功能活性檢測
最shi反應溫度下,在20ul反應體系中,1ul LabFD™ ApaLI能夠在15min內*消化1ugλDNA(HindIII digest)。
超長時間溫育檢測
最shi反應溫度下,將1ul LabFD™ ApaLI與1ug λDNA(HindIII digest)共同溫育3h,未檢測到其他核酸酶污染或星號活性引起的底物非特異性降解,延時酶切可能出現星號活性。
酶切-連接-再酶切檢測
最shi反應溫度下,使用1ul LabFD™ ApaLI消化底物,回收酶切產物。在22℃下使用適量Fast T4 DNA Ligase可以將酶切產物重新連接。將連接產物再次回收后,使用相同的內切酶可以重新切開連接產物。
非特異性內切酶活性檢測
最shi反應溫度下,將1ul LabFD™ ApaLI與1ug超螺旋質粒DNA共同溫育4h,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測,質粒DNA仍然處于超螺旋狀態(tài)。
使用方法
1.DNA快速酶切流程
1)在冰上按如下建議的加樣順序配制反應體系:
質粒DNA | PCR產物 | 基因組DNA | |
ddH2O | 15ul | 16ul | 30ul |
10×LabFD™ Buffer或10×LabFD™ Color Buffer | 2ul | 3ula | 5ul |
底物DNA | 2ul(up to 1ug) | 10ul(~0.2ug) | 10ul(5ug) |
LabFD™ ApaLI | 1ul | 1ul | 5ul |
Total | 20ul | 30ul | 50ul |
注:本體系適用于經過純化的PCR產物酶切,未純化的PCR具備一定的離子強度,10xLabFDTMbuffer加入量可適當減少至2ul。但由于DNA聚合酶同時具有外切酶活性,會影響酶切產物,因此如下一步需進行克隆等操作,建議酶切前對PCR產物進行純化。
2)輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時離心以收集掛壁液滴;
3)37℃溫育15min(質粒),或15~30min(PCR產物),或30~60min(基因組DNA);
4)80℃溫育20min即可使酶失活,停止反應。
2.雙酶切或多酶切
1)每種快速內切酶的用量為1ul,并根據需要適當擴大反應體系;
2)所有快速內切酶的體積總和不得超過總反應體系的1/10;
3)如果所用的幾種快速內切酶的最shi反應溫度不同,應先以最shi溫度低的酶開始酶切,再添加最shi溫度較高的酶,在其最shi反應溫度下進行酶切反應。
3.適用于質粒的擴大反應體系
DNA | 1ug | 2ug | 3ug | 4ug | 5ug |
LabFD™ ApaLI | 1ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
10×LabFD™ Buffer或10×LabFD™ Color Buffer | 2ul | 2ul | 3ul | 4ul | 5ul |
Total | 20ul | 20ul | 30ul | 40ul | 50ul |
注:如果總反應體系大于20ul,應適當增加溫育時間,盡量使用水浴、金屬浴或沙浴。
不同DNA中的酶切位點數量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
4 | 1 | 3 | 3 | 3 | 0 | 1 | 7 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無影響 | 無影響 | 序列可能重疊 剪切阻斷 | 無影響 | 無影響 |
在不同反應緩沖液中的活性
LabFD™ Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB CutSmart®Buffer | Takara QuickCut™Buffer | |
活性 | 百分之bai | 百分之bai | 百分之bai | 百分之bai |
注:活性數據來自LABLEAD限制酶標準反應體系下的檢測。