NEBNext®Q5熱啟動高保真PCR Master Mix是Q5高保真DNA聚合酶的原始熱啟動NEBNext配方。該制劑也作為成分包含在所有用于DNA和RNA文庫制備的原始NEBNext Ultra試劑盒中。
預混液中均有 Q5 超保真 DNA 聚合酶,它是一種具備熱穩(wěn)定性的新型 DNA 聚合酶,具有 3′→5′ 核酸外切酶活性,并且融合了具有增強持續(xù)合成能力的 Sso7d 結(jié)構(gòu)域。Q5 還具有優(yōu)異的保真度(比 Taq DNA 聚合酶高 280 倍),錯配率極低。
這款便捷的 2X 預混液包含 dNTP、Mg++ 以及專有緩沖液,僅需加入引物和 DNA 模板,即可穩(wěn)健擴增。加入熱啟動適配體后,可以更方便地在室溫下建立反應體系。
操作使用:
1. 使用高質(zhì)量、純化的DNA模板可大大提高PCR反應的成功率。50μl反應的DNA模板推薦量如下:
2. Mg++和添加劑:
NEBNext Q5 熱啟動 HiFi PCR 預混液在 1X 濃度下使用時含有 2.0 mM Mg ++。這對于使用該預混液產(chǎn)生的大多數(shù)PCR產(chǎn)物是最jia選擇。
3. 脫氧核苷酸:
dNTP的最終濃度經(jīng)過優(yōu)化,可實現(xiàn)穩(wěn)健的文庫擴增。Q5 高保真 DNA 聚合酶不能摻入 dUTP,不建議與含有尿嘧啶的引物或模板一起使用。
4. DNA聚合酶濃度:
NEBNext Q5 熱啟動 HiFi PCR 預混液中 DNA 聚合酶的濃度經(jīng)過優(yōu)化,可在各種條件下獲得最佳結(jié)果。
5. 變性:
對于大多數(shù)樣品類型,在 98°C 下 30 秒的初始變性就足夠了。在熱循環(huán)過程中,變性步驟應保持在zui低限度。通常,對于大多數(shù)模板,建議在 98°C 下變性 10 秒。
6. 退火:
對于 NEBNext 索引引物以外的 NGS 引物,Tm 可能不同。在這種情況下,在 Tm 下使用 30 秒(使用 NEB Tm 計算器),在 65°C 下使用 45 秒。
7. 外延:
推薦的延伸溫度為 65°C。 對于最大 1 kb 的庫,擴展時間通常為 30 秒。較大的刀片長度可能需要額外的時間。建議在 65°C 下最后一次延長 5 分鐘。
8. PCR產(chǎn)物:
使用 NEBNext Q5 熱啟動 HiFi PCR 預混液生成的 PCR 產(chǎn)物具有鈍端。
9. 磁珠兼容性:
NEBNext Q5 熱啟動 HiFi PCR 預混液與多種羧基化、甲苯磺?;玩溍褂H和素微珠兼容,這些微珠可繼承或包含在文庫構(gòu)建方案的 PCR 步驟中,包括 Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter, Inc.)、Sera-Mag SpeedBeads 和 Mag-Bind RXNPure Plus (Omega Bio-tek, Inc.)。建議使用SPRI微球或PCR純化柱進行PCR后純化。®®®
產(chǎn)品選購:
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
M0543S | Next Q5 熱啟動超保真 PCR 預混液 | 50 reactions |
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