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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 50T |
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貨號 | YLK10407P | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研實驗 | 保存條件 | 低溫運輸,-20℃保存 |
有效期 | 12個月 | 試劑盒說明 | 不同批號的試劑盒組分不可交互使用 |
水稻內(nèi)源基因SPS核酸檢測試劑盒
產(chǎn)品名稱:水稻內(nèi)源基因SPS核酸檢測試劑盒
英文名稱:Diagnostic Kit for SPS Gene DNA(Real-Time PCR Method)
本試劑盒適用于檢測轉(zhuǎn)基因植物的SPS基因,用于篩查待檢測植物中是否含有SPS成分。其檢測結(jié)果僅供參考。
本試劑盒用國家標準的SPS特異性引物和探針,用熒光PCR 技術(shù)進行轉(zhuǎn)基因成分的檢測。
【試劑組成】
名 稱 | 規(guī) 格 |
酶液 | 50μL×1管 |
SPS反應(yīng)液 | 1.0mL×1管 |
SPS陽性質(zhì)控品 | 50μL ×1管 |
陰性質(zhì)控品 | 250μL ×1管 |
【運輸及保存】
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、MJ Opticon2、LightCycler480、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【標本采集】
稱取200g樣品。
【保存和運輸】
上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標本運送應(yīng)采用0℃冰壺。
【注意事項】
1. 樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1 樣本前處理
固體樣本:用粉碎機或冷凍研磨儀將樣品研磨至細粉狀。
1.2 DNA提取
對于固體標本,DNA的提取可以采用SN/T 2584-2010中推薦的方法:
1) 每個樣品取2個平行管。稱取200mg粉碎的樣品,加入1mL預冷至4℃的抽提液,劇烈搖動混勻后,在冰上靜止5min,4℃條件下10000g離心15min,棄上清液;
2) 加入600uL預熱至65℃的裂解液,充分重懸沉淀,在65℃恒溫保持40min,期間顛倒混勻5次;
3) 室溫條件下10000g離心10min,取上清液轉(zhuǎn)移至新離心管中,加入5uLRNAseA,37℃恒溫30min,分別用等體積苯/酚:異戊醇溶液和三氯jia烷:異戊醇溶液各抽提一次;
4) 室溫條件下,10000g離心10min,取上清液至新離心管,加入三分之二體積的異丙醇,十分之一體積的3mol/L的乙酸鈉溶液(pH=6.5),-20℃放置2-3h;
5) 在4℃條件下,10000g離心15min,棄上清液,用70%乙醇洗滌沉淀一次,倒出乙醇,晾干沉淀;
6) 加入50uL TE(pH8.0)溶解沉淀,所得溶解即為樣品DNA溶液。
也可使用等效的DNA/提取試劑盒。
油脂樣本請直接選用市售油脂DNA/提取試劑盒,按說明操作。
2. 試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+1管陽性對照;樣品每滿7份,多配制1份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑 | SPS反應(yīng)液 | 酶液 |
用量 | 20μL | 1μL |
3. 加樣(樣本處理區(qū))
將步驟1提取的DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取4μL,加入相應(yīng)的
反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量PCR儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為25ul;熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)選擇NONE,請勿選擇ROX參比熒光。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟 | 循環(huán)數(shù) | 溫度 | 時間 | 收集熒光信號 |
1 | 1 cycle | 95℃ | 10min | 否 |
2 | 40 cycles | 94℃ | 15sec | 否 |
55℃ | 30sec | 是 |
5. 結(jié)果分析判定
5.1 結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置Baseline和Threshold:一般直接按機器自動分析的結(jié)果分析,當曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值(一般可在3~15范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop值(一般可在5~20范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及Threshold的Value值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結(jié)果。
5.2 結(jié)果判斷
陽性:檢測通道Ct值≤35,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線;
可疑:檢測通道35<Ct值≤38,建議重復檢測,如果檢測通道仍為35<Ct值≤38,且曲線有明顯的增長曲線,判定為陽性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。
6. 檢測方法的局限性
樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運送以及保存質(zhì)量有關(guān);
樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
陽性對照、擴增產(chǎn)物泄漏,會導致假陽性結(jié)果;
病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結(jié)果;
不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結(jié)果;
試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準確的結(jié)果;
本檢測結(jié)果僅供參考,如須確診請結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7. 質(zhì)控標準
陰性質(zhì)控品:Ct>38或無Ct值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,且Ct值≤32;
以上條件應(yīng)同時滿足,否則實驗視為無效。
【注意事項】
1.所有操作嚴格按照說明書進行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,wan全混勻并短暫離心;
3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
7.實驗完畢后用10%次氯酸或75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全通則》進行處理。