抗原間的相互關(guān)系分為三種，分別是互斥關(guān)系、子代與親代的關(guān)系和共表達(dá)關(guān)系。

互斥關(guān)系是指兩種抗原不會同時表達(dá)在一中細(xì)胞上，即表達(dá)A不表達(dá)B，表達(dá)B不表達(dá)A。配色時，互斥的抗原是允許熒光溢漏的。

子代與親代關(guān)系是指抗原之間是上下級關(guān)系，即下級抗原是在上級抗原的基礎(chǔ)上進(jìn)行分析的。

共表達(dá)關(guān)系是指兩種抗原同時表達(dá)在一種細(xì)胞上。配色時，共表達(dá)抗原要搭配熒光干擾較小的熒光素，盡量避免熒光溢漏。

什么樣的抗原屬于共表達(dá)抗原呢？以Treg細(xì)胞為例，Treg細(xì)胞同時表達(dá)CD25和Foxp3，那么CD25和Foxp3就屬于共表達(dá)關(guān)系。在這種情況下，CD25和Foxp3需要搭配相互之間沒有溢漏的熒光素，比如搭配APC和PE，因為這兩個熒光素是幾乎沒有干擾的，因此可獲得預(yù)期的數(shù)據(jù)結(jié)果。

在多色流式實驗中，如果兩個共表達(dá)Marker使用的熒光染料之間干擾較嚴(yán)重，則會對圈門造成干擾，影響實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。雖然我們也能通過調(diào)節(jié)補(bǔ)償來減少光譜重疊的影響，但對被干擾通道熒光靈敏度降低的影響是無法通過后續(xù)的結(jié)果分析來消除的。

如果共表達(dá)抗原之間有嚴(yán)重?zé)晒飧蓴_會怎么樣呢？那結(jié)果就可能出現(xiàn)如上圖右所示的情況，雖然進(jìn)行了補(bǔ)償調(diào)節(jié)，但得到的目的細(xì)胞的比例跟實際有差別。