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實(shí)驗(yàn)原理:
(一)Trizol 法
Trizol是一種酸性試劑,能從細(xì)胞和組織中快速分離RNA,其主要成分為異硫氰酸胍(GITC)和苯酚。裂解細(xì)胞后,GITC能使蛋白質(zhì)和RNase變性,有利于保護(hù)RNA的完整性;加入氯仿離心后,樣品分為水相和有機(jī)相,RNA存在于上層水相中,而DNA和蛋白質(zhì)則存在于中間層及下層有機(jī)相中,從而達(dá)到分離的目的。簡單來講就是裂解細(xì)胞使RNA得以釋放,加之有機(jī)溶劑使RNA與DNA、蛋白質(zhì)分離,并進(jìn)一步純化得到RNA的過程。
試劑、儀器與耗材:
Trizol試劑、氯仿、異丙醇、75%乙醇、RNase free Water、低溫冷凍離心機(jī)、勻漿器或組織研磨器、渦旋振蕩器、金屬浴、微量移液器、通風(fēng)櫥、計(jì)時(shí)器、1.5ml EP管等。
提取步驟:
1.樣品處理:
細(xì)胞:貼壁細(xì)胞每106細(xì)胞加入1ml裂解液,吹打混勻。
懸浮細(xì)胞:植物、動(dòng)物、酵母每10^6細(xì)胞加入1ml裂解液。
細(xì)菌細(xì)胞每107細(xì)胞加入1ml裂解液混勻。
組織:新鮮或-70℃凍存100mg組織加1ml裂解液,勻漿處理。
2.室溫放置5min,使核酸蛋白復(fù)合物全部分離;
3.向勻漿樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋好管蓋,劇烈振蕩15s,室溫放置3-5min;
4.2-8℃,12000rpm離心10min。RNA主要存在于上層水相中把水相轉(zhuǎn)移至新的EP管中(注:不可吸到沉淀);
5.吸附柱前處理:在吸附柱中加入500ul洗柱液,室溫放置2min,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液(小Tips:此步可以在第四步離心還剩2min左右的時(shí)候進(jìn)行,這樣第四步離心結(jié)束就可以直接進(jìn)行洗柱,而不需要再等時(shí)間);
6.在收集的上清中加入200ul無水乙醇混勻,加入吸附柱中靜置2min,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液;
7.向吸附柱中加入600ul漂洗液(注:新買的試劑盒中漂洗液還需要加入一定量的無水乙醇,此步一定要確認(rèn)漂洗液是否加入無水乙醇),2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液;
8.向吸附柱中加入600ul漂洗液,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液(注:漂洗液在7-8步共加了兩次哦);
9.12000rpm離心2min,棄掉收集管,將吸附柱置于室溫?cái)?shù)分鐘(10-15min)以去除殘留的漂洗液(注:最好在通風(fēng)櫥進(jìn)行,以免RNA酶對RNA的降解;通風(fēng)櫥在使用前也可先紫外30min);
10.將吸附柱放入新管中,向膜中央滴加50-100ul RNase free ddH2O(通常取中間值),室溫放置5min,12000rpm室溫離心2min即可得到RNA溶液(注:所有步驟中僅最后一步離心是在室溫,其余均在2-8℃,因此,前幾步離心拿出樣品后一定要及時(shí)關(guān)上離心機(jī)蓋子,以免升溫,而在第9步離心結(jié)束后就可以打開離心機(jī)蓋子使其快速升至室溫)。
四、 注意事項(xiàng)
1.佩戴手套、口罩,消毒操作臺(tái),杜絕外源酶的污染;
2.所用試劑耗材必須無酶化,有條件者可以直接購買,否則就要做好高壓滅菌的工作;
3.得到RNA溶液后可保存于-80℃,避免反復(fù)凍融,放置時(shí)間不可過長;
4.對于組織RNA的提取,一定要充分勻漿處理以使RNA充分釋放出來。
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