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應(yīng)用簡介
簡單來講,CRISPR/Cas9是一種分子生物學(xué)技術(shù),通過這種技術(shù)科研人員可以對細(xì)胞和生物體內(nèi)的基因進(jìn)行編輯。所謂的基因編輯就是通過某種生物手段和技術(shù),對生物體內(nèi)的遺傳物質(zhì)進(jìn)行修改。基于原核生物的獲得性免疫系統(tǒng)研發(fā)出的CRISPR/Cas9技術(shù)只包含兩種重要的成分,一種是行使DNA雙鏈切割功能的Cas9蛋白,而另一種則是具有導(dǎo)向功能的sgRNA(single guide RNA)。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)同時表達(dá)sgRNA和Cas9蛋白時,Cas9蛋白通過與sgRNA結(jié)合,靶向到目的DNA序列上發(fā)揮DNA雙鏈切割的功能。DNA序列被切割產(chǎn)生斷裂后,引發(fā)細(xì)胞內(nèi)部的DNA修復(fù)機(jī)制(DNA repair)。真核細(xì)胞同時存在著同源重組修復(fù)和非同源重組修復(fù)。在同源重組修復(fù)下,斷裂的染色體以另一條完整的姐妹染色單體為模板進(jìn)行DNA修復(fù),而在非同源重組修復(fù)下,斷裂出的DNA隨機(jī)修復(fù),引入新的堿基,使基因產(chǎn)生移碼突變。
技術(shù)原理
CRISPR/Cas9系統(tǒng)的工作原理是crRNA (CRISPR-derived RNA) 通過堿基配對與 tracrRNA (trans-activating RNA) 結(jié)合形成 tracrRNA/crRNA 復(fù)合物,此復(fù)合物引導(dǎo)核酸酶 Cas9 蛋白在與 crRNA 配對的序列靶位點(diǎn)處剪切雙鏈 DNA,從而實(shí)現(xiàn)對基因組DNA序列進(jìn)行編輯;而通過人工設(shè)計(jì)這兩種 RNA,可以改造形成具有引導(dǎo)作用的gRNA (guide RNA),用以引導(dǎo) Cas9 對 DNA 的定點(diǎn)切割。
靶位點(diǎn)的選擇要求:
1、靶位點(diǎn)主要包括20 個堿基,并且這20個堿基后面是NGG的PAM 區(qū);
2、靶位點(diǎn)盡量選擇在基因編碼區(qū)的前端;
3、轉(zhuǎn)化應(yīng)選擇對應(yīng)抗性的LB平板培養(yǎng)基。
實(shí)驗(yàn)方法
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