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簡(jiǎn)介
自然界中的微生物多如恒河沙數(shù),且其中絕大多數(shù)無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過(guò)了十萬(wàn)種,這還是一個(gè)正在急劇擴(kuò)大著的數(shù)字。DNA測(cè)序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準(zhǔn)確、快捷,不依賴(lài)菌種本身特點(diǎn),對(duì)所有菌種均可使用。晶能憑借先進(jìn)的測(cè)序儀器和多年的微生物檢測(cè)經(jīng)驗(yàn),為您可提供快速、高效、quan威的微生物檢測(cè)服務(wù),包括細(xì)菌16SrDNA測(cè)序、真菌18SrDNA測(cè)序、ITS測(cè)序。
16SrDNA測(cè)序——作為一種應(yīng)用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標(biāo)基因測(cè)序技術(shù),通過(guò)針對(duì)覆蓋16SrDNA的1個(gè)或多個(gè)連續(xù)可變性區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增測(cè)序來(lái)鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu),Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺(tái)可以針對(duì)16SrDNA的1個(gè)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,具有對(duì)樣本更高的測(cè)序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費(fèi)用的優(yōu)勢(shì)完成科研項(xiàng)目。
18SrDNA測(cè)序——18SrDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA(18SrRNA)的DNA序列,其高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。通過(guò)分析18SrDNA序列,在較高級(jí)別上確定樣品的歸屬。
ITS(internaltranscribedspacer)測(cè)序——真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internaltranscribedspacer,ITS),又叫內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),是位于真菌核糖體DNA(rDNA)上18S和28S基因之間的區(qū)域片段,主要包括內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1(ITS1)、5.8SrDNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(ITS2),其兩側(cè)分別是18SRNA基因和28SRNA基因
ITS序列由于選擇壓力小,在自然中變異較快,在絕大多數(shù)真菌中表現(xiàn)出序列多態(tài)性,表現(xiàn)為種內(nèi)相對(duì)一致,種間差異比較明顯,非常適合真菌鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育分析。由于ITS鑒定快速,分析準(zhǔn)確,有效彌補(bǔ)了傳統(tǒng)鑒定方法的不足,ITS的序列分析能實(shí)質(zhì)性地反映出屬間、種間以及菌株間的堿基對(duì)差異,易于分析,目前已被廣泛應(yīng)用于真菌屬內(nèi)不同種間或近似屬間的系統(tǒng)發(fā)育研究中。
流程圖
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1、擁有Miseq測(cè)序平臺(tái),高質(zhì)量、高性?xún)r(jià)比的完成客戶(hù)項(xiàng)目;
2、多項(xiàng)相關(guān)項(xiàng)目的經(jīng)驗(yàn),為客戶(hù)的項(xiàng)目提供保障。
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