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          技術(shù)文章

          預(yù)染蛋白marker常見問題及解決方法

          閱讀:463          發(fā)布時間:2023-2-8

          Q1:我使用了你們的一種預(yù)染蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行轉(zhuǎn)印,發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)印過程中條帶在膜上褪色了。為什么會這樣?

          A1褪色最可能是由于封閉/洗滌液中的洗滌劑將一些蛋白質(zhì)從膜上洗脫造成的。染料本身不會從蛋白質(zhì)上洗脫,因為它們是共價結(jié)合的。我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)較小孔徑的膜可以在封閉和洗滌過程中更好地保留蛋白質(zhì),因此,為了獲得的分辨率和蛋白質(zhì)保留率,推薦使用0.2 µm代替0.45 µm的膜。轉(zhuǎn)印后,可以用鉛筆在膜上圈出預(yù)染條帶,從而在封閉和處理后仍可辨認(rèn)條帶位置。
          Q2:我的蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)中的幾個條帶在凝膠上缺失。你們能幫我排查問題嗎?
          A2:
          1. *查使用的凝膠類型/凝膠百分比??赡軙捎谀z類型和/或百分比的不同而不能看到所有條帶。例如,蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品的最小條帶可能不能在非常低百分比的凝膠上分辨,而較高分子量條帶可能不能在高百分比凝膠上分辨。

          2. *檢查蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品的有效日期。由于蛋白質(zhì)降解,過期批次可能導(dǎo)致條帶褪色或缺失。

          3. *檢查蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品的儲存條件。不適當(dāng)?shù)膬Υ鏃l件會損害標(biāo)準(zhǔn)品中蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。

          4. *確保蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品在上樣到凝膠上之前未加熱/煮沸。我們的蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品可直接上樣,我們不建議將其加熱/煮沸,因為這可能會導(dǎo)致標(biāo)準(zhǔn)品中的蛋白質(zhì)降解。

          Q3:我使用了你們的一種蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品,并在泳道中看到了一些額外的條帶??梢蕴峁┮恍┙ㄗh嗎?
          A3:
          • *上樣時,請注意確保相鄰樣品泳道沒有交叉污染。

          • *確保每個泳道上標(biāo)準(zhǔn)品的量都是正確的。蛋白質(zhì)上樣過多會導(dǎo)致產(chǎn)生額外的條帶,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

          • *標(biāo)準(zhǔn)品儲存不當(dāng)或反復(fù)凍融會導(dǎo)致蛋白質(zhì)降解。

          Q4:我使用了你們的一種蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行轉(zhuǎn)印,發(fā)現(xiàn)一些小分子蛋白質(zhì)條帶穿過了膜。我該如何解決這個問題?
          A4:
          • *降低電壓、電流或縮短轉(zhuǎn)印時間

          • *確保轉(zhuǎn)膜緩沖液的甲醇濃度合適;可使用濃度為10–20%的甲醇,從而去除SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物中的SDS,并促進(jìn)蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合。

          • *確保轉(zhuǎn)膜緩沖液的SDS濃度合適(若加入了SDS),SDS濃度不要超過0.02–0.04%。過多的SDS會阻礙蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合。

          • *檢查膜的孔徑和靶標(biāo)蛋白質(zhì)的大小。小于10kDa的蛋白質(zhì)很容易穿過0.45μm孔徑的膜。如果您的目標(biāo)蛋白質(zhì)小于10 kDa,那么最好使用0.2μm孔徑的膜。

          Q5:我在Tris-甘氨酸凝膠上使用了一種預(yù)染標(biāo)準(zhǔn)品,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的分子量與在NuPAGE Bis-Tris凝膠上的分子量不同。這是什么原因?
          A5:預(yù)染標(biāo)準(zhǔn)品具有與每種蛋白質(zhì)共價結(jié)合的染料,這將導(dǎo)致標(biāo)準(zhǔn)品在不同的緩沖系統(tǒng)(即不同的凝膠)中遷移率不同。因此,使用預(yù)染標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行分子量估算將僅得出蛋白質(zhì)的表觀分子量。預(yù)染標(biāo)準(zhǔn)品可用于分子量估算、確認(rèn)凝膠遷移和估算轉(zhuǎn)膜效率,但對于需要精確估算分子量的應(yīng)用,應(yīng)使用非預(yù)染標(biāo)準(zhǔn)品。
          Q6:我使用了你們的一種蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行轉(zhuǎn)印,發(fā)現(xiàn)一些高分子蛋白質(zhì)條帶轉(zhuǎn)印到膜上的效果很差。可以提供一些提示嗎?
          A6:
          • *增加電壓、電流或轉(zhuǎn)印時間

          • *凝膠和SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物中的SDS會促進(jìn)蛋白質(zhì)從凝膠中洗脫,但抑制蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合。這種抑制作用在硝化纖維素膜上的強(qiáng)度大于PVDF膜。對于難以從凝膠中洗脫的蛋白質(zhì),如大分子量蛋白質(zhì),可在轉(zhuǎn)膜緩沖液中加入少量SDS以改善轉(zhuǎn)印效果。我們建議在組裝三明治前將凝膠置于含0.02–0.04% SDS的2x轉(zhuǎn)膜緩沖液(無甲醇)中預(yù)平衡10分鐘,然后使用含10%甲醇和0.01% SDS的1X轉(zhuǎn)膜緩沖液進(jìn)行轉(zhuǎn)印。

          • *甲醇可去除SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物中的SDS,促進(jìn)蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合,但對凝膠本身有一些不良影響,會降低轉(zhuǎn)印效率。甲醇可能導(dǎo)致孔徑減小、某些蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀以及一些堿性蛋白質(zhì)帶正電荷或變?yōu)橹行?。?yīng)確保轉(zhuǎn)膜緩沖液的甲醇濃度不高于10–20%,并使用高質(zhì)量的分析級甲醇。

          Q7:我使用了你們的一種蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品,它的條帶看起來不太明顯,很模糊。我該怎么操作?
          A7:
          • *確保每個泳道上標(biāo)準(zhǔn)品的量都是正確的。蛋白質(zhì)上樣過多會導(dǎo)致模糊,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

          • *條帶在低百分比凝膠中不能很好地分辨。嘗試使用更高百分比的凝膠。

          • *如果在轉(zhuǎn)膜/檢測后條帶看起來不明顯和模糊,可能是由于抗體濃度過高。遵循制造商建議的稀釋度或通過斑點(diǎn)印跡確定最適抗體濃度。

          Q8:我使用了你們的一種預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行轉(zhuǎn)印,但是膜上的轉(zhuǎn)印效果較差。可能出了什么問題?
          A8:
          • *凝膠上的分子量標(biāo)準(zhǔn)品的量不足: 將適當(dāng)體積的分子量標(biāo)準(zhǔn)品上樣到凝膠上。以下是我們的建議:(小型凝膠:每孔5μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔10μL(厚度1.5 mm);•大凝膠:每孔10μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔20μL(厚度1.5 mm))

          • *轉(zhuǎn)印不全或不理想: 優(yōu)化轉(zhuǎn)印條件

          Q9:我使用了你們的一種預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)品,這些條帶沒有很好地分離??赡苁鞘裁丛蛟斐傻??
          A9:
          • *樣品被煮沸: 丟棄煮沸的分裝樣品。

          • *使用的分子量標(biāo)準(zhǔn)品體積過大: 加入較少的體積或使用前用蛋白質(zhì)上樣緩沖液稀釋分子量標(biāo)準(zhǔn)品。


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