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新技術(shù)或開啟全新基因組研究領(lǐng)域
【導(dǎo)讀】 美國伊利諾伊大學(xué)的科學(xué)家正在開創(chuàng)性地開發(fā)一種基因工程新方法,用于支撐生物學(xué)和醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與應(yīng)用該研究,通過改進剪切DNA的精度和依從性,他們的工作將有潛力在基因組研究領(lǐng)域開啟一扇新的大門。
美國伊利諾伊大學(xué)的科學(xué)家正在開創(chuàng)性地開發(fā)一種基因工程新方法,用于支撐生物學(xué)和醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與應(yīng)用該研究,通過改進剪切DNA的精度和依從性,他們的工作將有潛力在基因組研究領(lǐng)域開啟一扇新的大門。研究成果發(fā)表在2017年2月6日出版的ACSSynthetic Biology期刊上。
利用該技術(shù),科學(xué)家可以創(chuàng)造高度活性的、具備幾乎任意長度序列特異性的、帶有粘性末端的人工限制性內(nèi)切酶。這是生物技術(shù)領(lǐng)域一個罕見的例子,可以對期望的生物功能或試劑進行有序和的理性設(shè)計。當(dāng)前,CRISPR-Cas9和TALENs是兩個常用的人工限制性內(nèi)切酶工具。
美國伊利諾伊大學(xué)的科學(xué)家正在開創(chuàng)性地開發(fā)一種基因工程新方法,用于支撐生物學(xué)和醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與應(yīng)用該研究,通過改進剪切DNA的精度和依從性,他們的工作將有潛力在基因組研究領(lǐng)域開啟一扇新的大門。研究成果發(fā)表在2017年2月6日出版的ACSSynthetic Biology期刊上。
利用該技術(shù),科學(xué)家可以創(chuàng)造高度活性的、具備幾乎任意長度序列特異性的、帶有粘性末端的人工限制性內(nèi)切酶。這是生物技術(shù)領(lǐng)域一個罕見的例子,可以對期望的生物功能或試劑進行有序和的理性設(shè)計。當(dāng)前,CRISPR-Cas9和TALENs是兩個常用的人工限制性內(nèi)切酶工具。
限制性內(nèi)切酶本身具有一個嚴(yán)重的瑕疵,即提示其進行剪切的識別序列很短,通常4-8個堿基對,為此,科學(xué)家則希望發(fā)現(xiàn)一種識別位點在微生物或質(zhì)粒中只出現(xiàn)一次的限制性內(nèi)切酶,這是科學(xué)家所面臨的重要難題之一。
該難題目前基于已發(fā)現(xiàn)的限制性內(nèi)切酶的數(shù)量(3600多種,其中250種可商用)得以部分解決。在該研究中,科學(xué)家們研究了超過100種不同的限制性內(nèi)切酶,他們將所有這些限制性內(nèi)切酶統(tǒng)一成由一種蛋白和兩種DNAguide構(gòu)成的單一系統(tǒng),研究人員不僅可以替換它們,還可以定位限制性內(nèi)切酶無法定位的位點。
該研究利用從Pyrococcusfuriosus獲得的Argonaute蛋白(PfAgo),PfAgo在DNAguide的引導(dǎo)下,可以識別更長的序列并發(fā)現(xiàn)剪切點,增加特異性的同時,移除限制性內(nèi)切酶帶來的阻礙。此外,PfAgo還能創(chuàng)造更長的粘性末端,這一點與其他限制性內(nèi)切酶相比又是一個切實的優(yōu)勢。
除了替代限制性內(nèi)切酶外,通過創(chuàng)造粘性末端,PfAgo可使大分子DNA組裝變得更容易,也可以對化學(xué)路徑和大基因的DNA分子進行克隆。