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關鍵詞:多肽合成與修飾|實驗技術服務
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測序實驗流程:
多肽是一種與生物體內各種細胞功能都相關的生物活性物質,它的分子結構介于氨基酸和蛋白質之間,是由多種氨基酸按照一定的排列順序通過肽鍵結合而成的化合物。多肽是涉及生物體內各種細胞功能的生物活性物質的總稱,常常被應用于功能分析、抗體研究、尤其是藥物研發(fā)等領域。
具體合成由下列幾個循環(huán)組成:
1) 去保護:Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑(piperidine)去 除氨基的保護基團。
2) 激活和交聯(lián):下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化?;罨膯误w與游離的氨基反應交聯(lián),形成肽鍵。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅使反應完成。循環(huán):這兩步反應反復循環(huán)直到合成完成。
3) 洗脫和脫保護:多肽從柱上洗脫下來,其保護基團被一種脫保護劑(TFA) 洗脫和脫保護。
試劑檢測:沒有選購在線檢測附件的多肽合成儀用戶,也可以采用試劑檢測方法做基本的耦合效果測定實驗。
固相多肽合成中,主要是通過檢測樹脂上游離氨基來判斷連接效率,檢測方法稱為Kaiser方法,其檢測結果,如果有游離氨基的時候,顯示蘭色,或紅褐色(pro,ser,His)。
Kaiser試劑包括:A,6% 茚三酮的乙醇溶液;B,80% 苯酚的乙醇溶液;C,2% 0.001M KCN的吡啶溶液
用線型梯變以每分鐘 0.5% 到 1.0% 改變的速度混合。常見分析和純化用柱為 4.6× 250mm (3-10μ m) 和 22× 250mm (10μ m). 如果用徑向填柱,那么大小是 8×100 ( 3-10μ m )和 25× 250mm (10μ m)大量各種緩沖劑含許多不同試劑,比如 heptafluorobutyric 酸, 0.1% 磷酸, 稀 Heformic 酸 (5-6%, pH2-4), 10 -100mM NH4HCO3, 醋酸鈉 / 氨, TFA/TEA ,磷酸鈉或鉀,異戊酚。這樣許多不同組合可形成緩沖劑,但要注意一點:硅反相柱料不能長時間暴露于高 pH ,甚至微堿 pH , 因為這樣會破壞柱子一般多肽分離拿150mm的柱子就可以了,250mm在分離度上改善不大,因為多肽的分離機理和小分子不同。小分子是通過液液交換,所以柱子越長交換越充分,分離度也越高。
Asp和Glu
Asp和Glu側鏈羧基常用t-Bu保護.可用TFA、TMSBr等脫除.但是用t-Bu保護仍有側鏈環(huán)化形成酰亞胺的副反應發(fā)生.近年來,發(fā)展了一些新的保護基如環(huán)烷醇酯、金剛烷醇酯等可減輕這一副反應,這些保護基可用TMSOTf(三氟甲磺酸*硅烷酯)除去.
Ser、Thr和Tyr
ser、Thr的羥基及Tyr的酚羥基通常用t-Bu保護.叔丁基的引入比較麻煩,首先ser制成芐氧羰基酯,再在酸催化下與異丁烯反應.Ser和Thr還可用芐基保護,Ser用芐醇引入芐基、Thr用溴芐引入芐基.
Asn和Gln
Asn和Gln側鏈的酰胺鍵在肽合成中一般不加以保護.但合成大肽時,Asn和Gln的α-羧基活化時可能會發(fā)生分子內脫氫反應生成氰基化合物.堿性時Gln的側鏈可以環(huán)化生成酰胺.而且不保護的Fmoc-Gln和Fmoc-Asn在DCM中溶解度很差.為了避免這些問題,可以用9-咕噸基,2,4,6-*氧芐基,4,4′―二甲氧二苯甲基或三苯甲基等保護,這四種基因均可用TFA脫除.
His
His是zui容易發(fā)生消旋化的氨基酸,必須加以保護.
對咪唑環(huán)的非π-N開始用芐基(Bzl)和甲基磺酰基(TOS)保護.但這兩種保護基均不太理想.TOS對親核試劑不穩(wěn)定,Bzl需要用氫解或Na/NHs除去,并且產生很大程度消旋.Boc基團是一個較理想的保護基,降低了咪唑環(huán)的堿性,抑制了消旋,成功地進行了一些合成.但是當反復地用堿處理時,也表現(xiàn)出一定的不穩(wěn)定性在堿中穩(wěn)定,但是沒能很好地抑制消旋,而且脫保護時要用很強的親核試劉如.
對咪唑環(huán)π-N保護,可以*抑制消旋,π-N可以用芐氧甲基(Bom)和叔丁氧甲基(Bum)保護,(Bum)可以用TFA脫除,Bom更穩(wěn)定些,需用催化氫解或強酸脫保護,Bum是目前很有發(fā)展前途的His側鏈保護基,其不足之處在于Fmoc(His)Bum在DCM和DMF中的溶解度較差.
Cys
Cys的-SH具有強親核性,易被?;闪蛎?,也易被氧化為二硫鍵,必須加以保護.常用保護基有三類:一類用TFA可脫除,如對甲芐基、對甲氧芐基和三苯甲基等;第二類可用(CF3CO)3T1/TFA脫除,對TFA穩(wěn)定.如t-Bu、Bom和乙酰胺甲基等.第三類對弱酸穩(wěn)定,如芐基和叔丁硫基(stBu)等,Cys(StBu)可用巰基試劑和磷試劑還原,Cys(Bzl)可用Na/NH3(1)脫保護.
Arg
Arg的胍基具有強親核性和堿性,必須加以保護.理想的情況是三個氮都加以保護,實際上保護1或2個胍基氮原子.保護基分四類:(1)硝基(2)烷氧羰基(3)磺?;?4)三苯甲基.
硝基在制備、?;呀庵挟a生很多副反應,應用不廣.烷氧羰基應主要有Boc和二金剛烷氧羰基(Adoc)2、Fmoc(Arg)Boc的耦聯(lián)反效率不高,理時不處穩(wěn)定,會發(fā)生副反應;Adoc保護了兩個非π-N,但有同樣的副反應發(fā)生.對磺?;Wo,其中TOS應用zui廣,但它較難脫除.近年來2,3,6-*基-4-甲氧苯橫酰基(Mtr)較受歡迎,在TFA作用下,30分鐘即可脫除,但是它們都不能*抑制側鏈的?;l(fā)生.三苯甲基保護基可用TFA脫除.缺點是反應較慢,側鏈仍有?;磻移湓贒CM、DMF中溶解度不好.
Lys
Lys的ε-NH2必須加以保護.但與α-NH2的保護方式應不同,該保護基要到肽鏈合成后除去.ε-NH2的保護無消旋問題,可以采用?;Wo基,其它常用的保護基有芐氧碳基
Fmoc基團的脫除
Fmoc基團的芴環(huán)系的吸電子作用使9-H具有酸性,易被較弱堿除去,反應條件很溫和.反應過程可表示如下:進攻9-H,β消除形成二苯芴烯,很容易被二級環(huán)胺進攻形成穩(wěn)定的加成物.Fmoc基團對不同的堿穩(wěn)定性不同,可根據(jù)實際條件選用.
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