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在DNA提取過程中應(yīng)盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為后續(xù)的實驗打下基礎(chǔ)。一般真核細(xì)胞基因組DNA有107-9bp,可以從新鮮組織、培養(yǎng)細(xì)胞或低溫保存的組織細(xì)胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細(xì)胞,隨后用酚抽提而實現(xiàn)的。
實驗方法
- 制備DNA
實驗材料 | 動物組織 |
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試劑、試劑盒 | PBS 乙酸銨 乙醇 酚 氯仿 異戊醇 TE |
儀器、耗材 | 離心機(jī) 搖床 研缽 |
實驗步驟 | 1. 切下組織并立即剪成小塊,置于液氮中凍結(jié)。 2. 將200 mg~1 g 的組織用預(yù)冷的研缽和研杵研碎,或用錘子將其搗為細(xì)粉末,每100 mg 組織用1. 2 ml 消化緩沖液懸浮。 3. 500 g 離心細(xì)胞5 min,棄上請。貼壁生長細(xì)胞先用胰酶消化。 4. 細(xì)胞用1~10 ml 冰冷的PBS重懸,500 g 離心5 min,棄上清,重復(fù)1次。 5. 用1體積 的消化緩沖液重懸細(xì)胞。 6. 將樣品在蓋緊的管中于50℃搖蕩下溫育12~18 h。 7. 用等體積的酚/氯仿/異戊酵抽提樣品,1 700 g 離心10 min。 8. 如果樣品溶解得不好, 再加1體積不含蛋白酹K的消化緩沖液,并重復(fù)離心。 9 如果在界面上有一層厚的白色物質(zhì),重復(fù)有機(jī)抽提,將上層(水溶液)轉(zhuǎn)移至一個新管中。 10. 加入1/2體積7.5 ml 乙酸銨和2體積100%乙醉,1 700 g 離心2 min。 11. 用70%乙酵洗滌,晾干,沉淀用TE。 12. 緩沖液重新溶解,使終濃度在約1 mg/ml 左右 |