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PCR儀作為分子生物學相關(guān)實驗的常規(guī)儀器,每年都有數(shù)千臺的選購量,這兩年一批國產(chǎn)PCR儀正在興起。購買國產(chǎn)PCR儀需要考慮以下因素:
1、樣本管的種類
現(xiàn)在主要有0.2ml和0.5ml兩種,使用0.5ml PCR管的人員已經(jīng)很少了,一是0.5ml PCR專用的薄壁管很少見,二是如果想要較大體積的PCR產(chǎn)物,可以通過多分幾個0.2ml PCR管來實現(xiàn)。除非經(jīng)常需要較大體積的PCR產(chǎn)物,否則可以不必考慮0.5ml型的PCR儀。
2、樣本容量
種類很多,0.2ml的有96孔和48孔,0.5ml的有60孔和30孔,384孔等,當然還有一些其他組合:如0.2ml的48孔與0.5ml的30孔組合。購買96孔的還是48孔的PCR儀主要從經(jīng)濟上考慮,當然現(xiàn)在很多的廠家都有雙48孔的產(chǎn)品,可以當兩臺48孔的PCR儀使用,也是一個比較好的選擇,但48孔的PCR儀大都沒有梯度功能。
一般來講384孔都是用384孔的,對封膜的要求比較高,一定要采用專門用于PCR反應的膜,普通封板膜會影響PCR反應,造成實驗失敗。還有一些特別的PCR儀,如用于原位PCR的。
3、溫度梯度功能
即不同列或不同行之間溫度可以為不同的溫度。這一功能對于固定PCR程序的檢驗人員來講,可能用處不大,但對于經(jīng)常進行不同基因擴增的研究人員來講可以說是必須的。因為大家都知道PCR反應的復性溫度是PCR成功的要素,PCR復性溫度只有通過溫度梯度實驗來選擇才是適宜的,你可以通過溫度梯度實驗了解到實驗成功的復性溫度范圍,選擇中間的一個溫度點來保證實驗的可重復性。朗基T20、T30 PCR儀就屬于這一類。
通過理論計算得到的復性溫度可以作為溫度梯度實驗的中心點來使用,如果認為這一溫度就是好的復性溫度則是錯誤的。因為復性的溫度與緩沖液中的離子強度、DMSO的含量、Mg2+離子的濃度等都有直接關(guān)系,而研究人員一般并不了解所用的緩沖液中這些因素的含量或是在計算時都采用了缺省值。
另外,假設(shè)理論計算是正確的,但PCR儀的溫度還有準確性和精確性的問題,一般都在±0.3至±0.5,也會影響到實驗的重復性,通過實驗來確定復性溫度可以解決儀器準確性問題。這也是有些實驗在一臺儀器上做得很好,換一臺儀器就不好的一個原因。當然溫度梯度功能也可用于變性溫度等的優(yōu)化。
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