RNA質(zhì)控,我來幫你!
小編心里話:RNA質(zhì)控是個技術(shù)活兒!
對于每天泡在實驗室的人來說,qPCR已是家常便飯。毫無疑問濃度高,純度好,片段完整,才是我們理想中的RNA樣品。然而,RNA總是嬌氣的存在!室溫或4度極易降解,提取的時候容易有污染物殘留。因此完整的RNA質(zhì)控包含了三個方面:濃度質(zhì)控,純度質(zhì)控,片段完整性質(zhì)控。
如何把控RNA質(zhì)量,繼續(xù)反轉(zhuǎn)錄呢?
有一款RNA質(zhì)控的高手,既可以提供RNA濃度質(zhì)控,也可以提供RNA純度質(zhì)控,沒錯,就是美國Denovix公司提供的DS-11FX超微量紫外/熒光全功能分光光度計,看上去酷酷的RNA純度質(zhì)控的標(biāo)準(zhǔn)方法是超微量分光光度計(光吸收)法,通過監(jiān)控A260/230和A260/280的比值來判定RNA的純度。通常A260/280的比值范圍在1.8-2.0之間,如果大于2.0則說明RNA已經(jīng)降解,如果低于1.8則說明含有蛋白質(zhì)或其他雜質(zhì);而A260/230的比值如果小于2,則表明RNA中含有酚類,鹽等雜質(zhì)。DS-11FX的微量光度計功能可以幫助科研人員來準(zhǔn)確的判定RNA樣品的純度。
下圖為RNA紫外法檢測示意圖,A260/280和A260/230都不在正常的比值范圍,說明RNA樣品純度很差,儀器會自動進(jìn)行提示,兩個黃色小三角就是警示圖標(biāo)哦,點擊萌萌的黃色三角警示,儀器會顯示污染物的種類,夠智能吧,這就是DS-11的SmartQC功能
圖1 總RNA的測量界面圖(美國DeNovix,DS-11FX)
RNA濃度質(zhì)控的標(biāo)準(zhǔn)方法是熒光法,除非是純度很高的RNA也可以采用紫外法。熒光法采用RNA特異性染料,可以準(zhǔn)確的測量RNA濃度。DS-11FX不但提供RNA濃度質(zhì)控,也可以提供DNA和蛋白的濃度精確控制,功能超級強(qiáng)大哦。
dsDNA,RNA,ssDNA,Protein單獨的熒光檢測app
發(fā)表在Cell stem cell的文章PAX3 Confers Functional Heterogeneity in Skeletal Muscle Stem Cell Responses to Environmental Stress,作者提取衛(wèi)星細(xì)胞的總RNA,采用DS-11FX超微量/熒光全功能分光光度計進(jìn)行RT-PCR之前的RNA的質(zhì)量把控和濃度鑒定。