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        1. 迪圖(上海)生物科技有限公司
          中級會(huì)員 | 第21年

          18017111930

          美國ABI 賽默飛
          艾本德離心機(jī)
          德國默克密理博
          美國Bio-Rad 伯樂
          德國IKA系列
          移液器/移液槍
          生命科學(xué)儀器
          食品安全檢測試劑
          農(nóng)藥速檢測儀
          食品安全檢測儀
          制冰機(jī)
          酶標(biāo)儀
          奧林巴斯顯微鏡
          實(shí)驗(yàn)室設(shè)備
          混勻儀
          金屬浴
          哈希水質(zhì)檢測儀
          瑞士梅特勒天平
          生化分析儀器
          滅菌器|生物安全
          電子天平
          水分儀
          測溫儀
          光度計(jì)
          搖床
          電化學(xué)|水質(zhì)測定儀
          意大利HANNA水質(zhì)分析儀
          氮吹儀
          美國Brookfield(博勒飛)
          土壤分析儀
          德國Sartorius系列
          環(huán)境檢測
          物理特性分析儀器
          通用分析儀器
          藥物檢測
          清洗機(jī)
          培養(yǎng)箱
          天隆

          凝膠成像分析系統(tǒng)的組成及用途

          時(shí)間:2017/2/6閱讀:8965
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          一、凝膠成像分析系統(tǒng)的組成
              凝膠成像系統(tǒng)的基本組成包含:CCD相機(jī)、鏡頭、暗室和分析軟件。不過其功能不僅于對瓊脂糖凝膠進(jìn)行成像,現(xiàn)在的成像儀趨向于多功能化,還適用于蛋白膠、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸、印跡膜和菌落平板等應(yīng)用。在Western Blot方面,高性能的化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)能與膠片媲美。

          二、CCD
              CCD是電荷耦合器件(Charge Coupled Device)的英文名稱縮寫,是一種光電轉(zhuǎn)換器件。是凝膠成像系統(tǒng)的核心部件。絕大多數(shù)對數(shù)碼相機(jī)都有一定的了解,不少人還是這方面的專家。有人把數(shù)碼相機(jī)的像素看得很重,但比較之后發(fā)現(xiàn),有些400萬、500萬像素的相機(jī)拍出來的片子沒有300像素的機(jī)子拍出來的好,這是為什么?其實(shí),影響成像的因素很多,衡量CCD好壞的指標(biāo),有分辨率,CCD尺寸,動(dòng)態(tài)范圍,靈敏度,量子效率,信噪比等,其中像素?cái)?shù)以及CCD尺寸是重要的指標(biāo)。其實(shí)是說感光器件的面積大小,這里就包括了CCD感光器件的面積越大,也即CCD面積越大,捕獲的光子越多,感光性能越好,信噪比越低。
          為了方便您更了解CCD的大小,現(xiàn)列舉目前市場上所應(yīng)用的CCD規(guī)格如下:
          1英寸——靶面尺寸為寬12.7mm*高9.6mm,對角線16mm.
          2/3英寸——靶面尺寸為寬8.8mm*高6.6mm,對角線11mm.
          1/2英寸——靶面尺寸為寬6.4mm*高4.8mm,對角線8mm.
          1/3英寸——靶面尺寸為寬4.8mm*高3.6mm,對角線6mm.
          1/4英寸——靶面尺寸為寬3.2mm*高2.4mm,對角線4mm.

          三、制冷CCD
              相同滿井電子的CCD,降低CCD噪音,就能提高CCD的檢測能力,熱或者暗電流對于CCD都是噪音,噪音在Cool CCD基本都可以被深度致冷的Peltier消除。在曝光*過5-10秒,CCD芯片就會(huì)發(fā)熱,沒有制冷設(shè)備的芯片,“熱”或者白的像素點(diǎn)就會(huì)遮蓋圖像,圖像到處可見雪花。CCD結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)、數(shù)字化的方法等都會(huì)影響噪音的產(chǎn)生。當(dāng)然通過改善結(jié)構(gòu)、優(yōu)化方法,同樣能減少噪音的產(chǎn)生。
          制冷CCD的適用性:熒光及化學(xué)發(fā)光本身較弱,所以對CCD噪音的降低要求很高,應(yīng)選用高分辨率數(shù)字制冷CCD相機(jī)結(jié)合高通透鏡頭系統(tǒng),使其能夠捕獲到信號極其微弱的熒光及化學(xué)發(fā)光樣品圖像,并且能夠較為大程度的降低噪音,減少背景,提供出色的圖像清晰度。另外可選激發(fā)光源及多位濾鏡輪擴(kuò)大了熒光/化學(xué)發(fā)光成像的應(yīng)用范圍。所以一般在熒光及化學(xué)發(fā)光觀察時(shí)需要選擇制冷CCD。所以制冷CCD相機(jī)是分子影像成像分析系統(tǒng)的未來的發(fā)展趨勢和必須要求。

          (1)、分辨率
              分辨率的大小和像素值是分不開的,像素指得是CCD能分別的較為小的感光元件,我們平時(shí)說的多少萬像素就是這些感光元件的個(gè)數(shù)了。所以一般來講像素越多,成像也就越清晰細(xì)膩,當(dāng)然這其中還要受許多因素限制,下面會(huì)慢慢提到的。但是高像素也不一定是好的CCD,其原因就是像素大?。≒ixel Size),也是很重要的因素,相同數(shù)目的像素,排列越密集,像素之間就越容易出現(xiàn)電流干擾,容易出現(xiàn)"噪點(diǎn)"等干擾成像質(zhì)量的現(xiàn)象出現(xiàn)。由于制造工藝的限制,增加尺寸,成本將會(huì)以幾何級數(shù)提高。
          現(xiàn)在大部分廠家的CCD為了提高圖像的靈敏度,會(huì)使用像素合并的技術(shù),那么像素合并的意義是什么呢?
          像素合并是一種非常有用的功能,它可被用來提高像素的大小和靈敏度,如CCD分辨率為1392X1040,像素大小為6.45um,當(dāng)經(jīng)過2X2合并后,分辨率變成696X520,像素大小為12.9um.但經(jīng)過4X4合并后,分辨率只有348X260,分辨率太小,在實(shí)際應(yīng)用中就沒有太多意義了。

          (2)、動(dòng)態(tài)范圍值
              動(dòng)態(tài)范圍表示在一個(gè)圖像中較為亮與較為暗的比值。

                灰階表示在一種表征光亮度的方法,12bit表示從較為暗到較為亮等分為2^12=4096個(gè)級別,16bit即為2^16=65536個(gè)級別,可見bit值越高能分出的細(xì)微差別越大. 

                12bit與16bit在圖像分辨上的區(qū)別

             對動(dòng)態(tài)范圍進(jìn)行量化需要一個(gè)運(yùn)算公式,即動(dòng)態(tài)范圍值 = 20 log (well depth/read noise),其中Well depth代表是滿井電子,是CCD飽和時(shí)能接受的電子信號總值,read noise是讀出噪聲(以電子數(shù)來表示),每個(gè)CCD在讀數(shù)的過程中都會(huì)產(chǎn)生噪聲,噪聲越小,監(jiān)測靈敏度越高。其中滿井電子與CCD的bit值是相關(guān)的,通常下,bit值越高,滿井電子的數(shù)值越大。
          舉例如下:
          Well depth = 85,000 個(gè)電子, read noise = 12 個(gè)電子
          Dynamic range = 20 log (85,000/12), or 77dB.
          動(dòng)態(tài)范圍的值越高CCD性能越好.

          (3)、量子效率  
              CCD的量子效率也稱像素靈敏度,指在一定的曝光量下,像素勢阱中所積累的電荷數(shù)與入射到像素表面上的光子數(shù)之比。不同結(jié)構(gòu)的CCD其量子效率差異很大。比如100光子中積累到像素勢阱中的電荷數(shù)是50個(gè),則量子效率為50%(100 photons = 50 electrons means 50% efficiency)。值得注意的是CCD 的量子效率與入射光的波長有關(guān)。

          (4)、信噪比
              說到信噪比就不得不提到暗電流了,
          暗電流是導(dǎo)致CCD噪音的很重要的因素。暗電流指在沒有曝光的情況下,在一定的時(shí)間內(nèi),CCD傳感器中像素產(chǎn)生的電荷。我們在做化學(xué)發(fā)光檢測的時(shí)候,需要的曝光的時(shí)候比較長,這樣導(dǎo)致CCD產(chǎn)生較多的暗電流,對圖像的質(zhì)量影響非常大。通常情況下通過降低CCD的溫度來較為大限度的減少暗電流對成像的

              影響。CCD產(chǎn)生的暗電流隨著溫度下降而減少,但是在-23℃下開始趨于平緩,由此可以得出溫度并非需要無休止的降低的。所以在選擇冷CCD時(shí),溫度在-25℃(溫度,非室溫以下)下一般就可以達(dá)到您的要求了。
              有的CCD是在圖像較為終生成后,通過軟件去背景來扣除暗電流,對于信號遠(yuǎn)遠(yuǎn)強(qiáng)于背景的有一定效果,但是對于弱信號處理過程中會(huì)產(chǎn)生越來越多的錯(cuò)誤。

             
           
          (5)、光學(xué)鏡頭
              光學(xué)鏡頭是機(jī)器視覺系統(tǒng)中*的部件,直接影響成像質(zhì)量的優(yōu)劣,影響算法的實(shí)現(xiàn)和效果。光學(xué)鏡頭規(guī)格繁多,有時(shí)不免頭暈。光學(xué)鏡頭從焦距上可分為短焦鏡頭、中焦鏡頭,長焦鏡頭;從視場大小分有廣角、標(biāo)準(zhǔn),遠(yuǎn)攝鏡頭;結(jié)構(gòu)上分有固定光圈定焦鏡頭,手動(dòng)光圈定焦鏡頭,自動(dòng)光圈定焦鏡頭,手動(dòng)變焦鏡頭、自動(dòng)變焦鏡頭,自動(dòng)光圈電動(dòng)變焦鏡頭,電動(dòng)三可變(光圈、焦距、聚焦均可變)鏡頭等。

          (6)濾光鏡片
              熒光:EB 、TLC plates、GFP plates、SYBR Green、SYBR Gold、SYBR Safe、SYPRO Red、SYPRO Orange、Texas Red、Rhodamine Red、Fluorescein、Deep Purple、Cy2、Cy3、Cy3.5、Cy5、熒光板等
             (要根據(jù)具體的激發(fā)光源和濾鏡來決定)


          光源

          激發(fā)波長

          吸收波長

          染料

          Blue

          475nm

          537nm

          SYBR Green、SYBR Gold、SYBR Safe、SYPRO Orange、Cy2等

          Green

          534nm

          606nm

          SYPRO Red、Cy3等

          Red

          632nm

          609nm

          Texas Red、Rhodamine Red 、Cy5等

           

          凝膠成像系統(tǒng)特點(diǎn):

          1. 暗箱模具成型,小巧美觀、抗干擾、密封性好!
          2. 專業(yè)化凝膠圖像分析軟件,全中文操作界面,自動(dòng)識別8 bit、10bit、12 bit、16 bit圖像,友好的人機(jī)界面,操作簡便,功能強(qiáng)大,可對凝膠圖像進(jìn)行采集、編輯、分析及管理
          3. 日本原裝高分辨率變焦光學(xué)鏡頭
          4. 安全實(shí)用的凝膠切割工作裝置
          5. 全電腦控制所有操作過程,高度程序化(電腦控制暗箱/紫外及白光/光圈/變焦/焦距)
          6. 定時(shí)關(guān)機(jī):用戶可自行設(shè)定定時(shí)關(guān)閉紫外光源的時(shí)間
          7. 拍攝范圍:較為大成像面積21cm×26cm
          8. 光源:多個(gè)輔助光源包括紫外透照,白光透照,紫外反射,白光反射等

          主要功能:

            1.凝膠圖像剪輯處理,標(biāo)記;

            2.自動(dòng)尋找凝膠條帶;

            3.與公用的標(biāo)準(zhǔn)條帶或自選的標(biāo)準(zhǔn)條帶比較;

            4.條帶(泳道)遷移路徑的校正;

            5.核酸、蛋白的處理,計(jì)算相應(yīng)的分子量等數(shù)值;

          6.詳細(xì)的分析結(jié)果可輸出成EXCEL格式,根據(jù)需要編輯。

           

          適用范圍:

           

          從整體總的來說凝膠成像(系統(tǒng))可應(yīng)用于:蛋白質(zhì)、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸等其他生物分子的分離純化結(jié)果作定性分析

            (1)分子量定量

            對于一般常用的DNA膠片,利用分子量定量功能,通過對膠上DNA Marker條帶的已知分子量注釋,自動(dòng)生成擬合曲線,并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過這種方法所得到的結(jié)果較肉眼觀察估計(jì)要準(zhǔn)確很多。

           ?。?)密度定量

            一般常用的測定DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)濃度的方法是紫外吸收法,但它只能測定樣品中的總核苷酸濃度,而不能區(qū)分各個(gè)長度片段的濃度。利用凝膠成像系統(tǒng)和軟件,先將DNA膠片上某一已知其DNA含量的標(biāo)準(zhǔn)條帶進(jìn)行密度標(biāo)定以后,可以方便的單擊其他未知條帶,根據(jù)與已知條帶的密度做比較,可以得到未知DNA的含量。此方法也適用于對PA GE蛋白膠條帶的濃度測定。

            (3)密度掃描

            在分子生物學(xué)和生物工程研究中,我們較為常用到的是對蛋白表達(dá)產(chǎn)物占整個(gè)菌體蛋白的百分含量的計(jì)算。傳統(tǒng)的方法就是利用的密度掃描,但利用生物分析軟件結(jié)合現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)室常規(guī)配備的掃描儀或者直接用白光照射的凝膠成像就能完成此項(xiàng)工作。

           ?。?)PCR定量

          PCR定量主要是指,如果PCR實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增出來的條帶不是一條,那么可以利用軟件計(jì)算出各個(gè)條帶占總體條帶的相對百分?jǐn)?shù)。就此功能而言,與密度掃描類似,但實(shí)際在原理上并不相同。PCR定量是對選定的幾條帶進(jìn)行相對密度定量并計(jì)算其占總和的百分?jǐn)?shù),密度掃描時(shí)并對選擇區(qū)域生成縱向掃描曲線圖并積分。

           

          凝膠成像的分類:

           (1)普通凝膠成像分析系統(tǒng):可以對蛋白電泳凝膠,DNA凝膠樣品進(jìn)行圖象采集并進(jìn)行定性和定量分析,樣品包括:EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、Radiant Red等染色的核酸監(jiān)測;以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、各種染色的蛋白質(zhì)凝膠如考染等。(或UV,EB和有色及可見樣品成像);

           ?。?)化學(xué)發(fā)光成像分析系統(tǒng):成像范圍涵蓋UV,EB,化學(xué)發(fā)光、紫外-熒光、有色及可見樣品成像;

           ?。?)多色熒光成像分析系統(tǒng):成像范圍涵蓋UV,EB,化學(xué)發(fā)光、多色熒光熒光、有色及可見樣品成像;

           ?。?)多功能活體成像分析系統(tǒng):UV,EB,化學(xué)發(fā)光、多色熒光熒光、有色及可見樣品成像和離體組織和小型動(dòng)物,及大型型動(dòng)物。

             

          較為后是品牌推薦:

            進(jìn)口品牌美國的市場上見的是相對比較多的有:UVP、伯樂、alpha、SIM、KODAK、GE、Wealtec等;德國品牌主要有:Royal、Raytest等;英國品牌:UVI、Fedbio等;以色列DNR;荷蘭Isogen等等。目前這些國內(nèi)進(jìn)口品牌和國產(chǎn)品牌的市場差不多,但是價(jià)格肯定是高于國產(chǎn)品牌。

          中國本土企業(yè)也掌握了凝膠成像核心技術(shù),性能方面不比進(jìn)口差,價(jià)格又比進(jìn)口的低,本土的品牌大致上可見:北京六一、君意東方、上海領(lǐng)成、上海培清、上海山富、上海復(fù)日、上海嘉鵬、上海勤翔、江蘇捷達(dá)等品牌。

           


           

           

             


           

           

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