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恒遠(yuǎn)告訴大家:關(guān)于WB實(shí)驗(yàn)的常見(jiàn)問(wèn)題以及解決方案(3)
閱讀:2268 發(fā)布時(shí)間:2012-9-14
上海恒遠(yuǎn)生物科技有限公司是一家生物技術(shù)企業(yè),主要從事免疫學(xué)、分子生物學(xué)和常規(guī)生化試劑的研發(fā)、銷(xiāo)售。并代理銷(xiāo)售Omega、Sigma、R&D、ATCC、HYCLONE等二十多家國(guó)外,致力于為廣大高校、科研院所和企事業(yè)單位提供*的科研試劑和完善的技術(shù)服務(wù),滿(mǎn)足生物化學(xué)、分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、免疫學(xué)等生物科技實(shí)驗(yàn)需求。
21、想分離的蛋白是分子量200kd的,SDS-PAGE電泳的分離膠濃度多大合適?積層膠的濃度又該用多少?這么大分子量的蛋白容易作Western Blot嗎?
答:200kd的蛋白不好做,分離膠用7%,積層膠 3.5%。
22、如果上樣量超載,要用什么方法來(lái)增加上樣量?
答:可以濃縮樣品,也可以根據(jù)你的目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會(huì)有問(wèn)題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm的。
23、蛋白變性后可以存放多久?
答:-80℃,一兩年沒(méi)有問(wèn)題。zui關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細(xì)菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所測(cè)定的蛋白分子量是105KD,按理說(shuō)分離膠應(yīng)當(dāng)采用7.5%,但資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,不知為何?
答:上述提到的兩種凝膠均可以使用,因?yàn)?/span>105KD的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意條帶位置。
25、二抗是生物素化的抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說(shuō)脫脂奶粉會(huì)影響親和素生物素的,是嗎?
解答:不能使用脫脂奶粉,因?yàn)槊撝谭壑泻锼?,用BSA代替?yīng)該好一點(diǎn).
26、問(wèn)一般一次上樣的蛋白總量是多少,跟目的蛋白的表達(dá)量有關(guān)系嗎?
答:Western Blot一般上樣30-100微克不等,結(jié)果跟目的蛋白的豐度、上樣量、一二抗的量和孵育時(shí)間都有關(guān)系,也與顯色時(shí)間長(zhǎng)短有關(guān)。開(kāi)始摸條件時(shí),為了拿到陽(yáng)性結(jié)果,各個(gè)步驟都可以量多一點(diǎn)時(shí)間長(zhǎng)一點(diǎn),當(dāng)然背景也就出來(lái)了。要拿到好的結(jié)果,如果抗體好的話比較容易,抗體不好的話就需要反復(fù)地試了,當(dāng)然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行。
27、做組織樣品的western的時(shí)候,怎樣處理樣品?
答:必須進(jìn)行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會(huì)更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28、問(wèn)大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot時(shí)要注意,分離膠選擇>7%的;剝膠時(shí)要小心;轉(zhuǎn)移時(shí)間需要相應(yīng)延長(zhǎng);要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上樣量?
答:a)可以濃縮樣品;增大上樣體積來(lái)增大上樣量;b)用5倍的上樣緩沖液來(lái)稀釋變性
30、蛋白的上樣量有沒(méi)有什么具體的要求?
答:上樣量要根據(jù)實(shí)驗(yàn)的要求來(lái)定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等,如果只是要定性,則沒(méi)有太大的關(guān)系,盡量多上就行了,但是不要超載。
答:200kd的蛋白不好做,分離膠用7%,積層膠 3.5%。
22、如果上樣量超載,要用什么方法來(lái)增加上樣量?
答:可以濃縮樣品,也可以根據(jù)你的目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會(huì)有問(wèn)題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm的。
23、蛋白變性后可以存放多久?
答:-80℃,一兩年沒(méi)有問(wèn)題。zui關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細(xì)菌消化掉(也是被酶水解了)。
24、我所測(cè)定的蛋白分子量是105KD,按理說(shuō)分離膠應(yīng)當(dāng)采用7.5%,但資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,不知為何?
答:上述提到的兩種凝膠均可以使用,因?yàn)?/span>105KD的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意條帶位置。
25、二抗是生物素化的抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說(shuō)脫脂奶粉會(huì)影響親和素生物素的,是嗎?
解答:不能使用脫脂奶粉,因?yàn)槊撝谭壑泻锼?,用BSA代替?yīng)該好一點(diǎn).
26、問(wèn)一般一次上樣的蛋白總量是多少,跟目的蛋白的表達(dá)量有關(guān)系嗎?
答:Western Blot一般上樣30-100微克不等,結(jié)果跟目的蛋白的豐度、上樣量、一二抗的量和孵育時(shí)間都有關(guān)系,也與顯色時(shí)間長(zhǎng)短有關(guān)。開(kāi)始摸條件時(shí),為了拿到陽(yáng)性結(jié)果,各個(gè)步驟都可以量多一點(diǎn)時(shí)間長(zhǎng)一點(diǎn),當(dāng)然背景也就出來(lái)了。要拿到好的結(jié)果,如果抗體好的話比較容易,抗體不好的話就需要反復(fù)地試了,當(dāng)然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行。
27、做組織樣品的western的時(shí)候,怎樣處理樣品?
答:必須進(jìn)行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會(huì)更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28、問(wèn)大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot時(shí)要注意,分離膠選擇>7%的;剝膠時(shí)要小心;轉(zhuǎn)移時(shí)間需要相應(yīng)延長(zhǎng);要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析)。
29、有什么方法可以提高上樣量?
答:a)可以濃縮樣品;增大上樣體積來(lái)增大上樣量;b)用5倍的上樣緩沖液來(lái)稀釋變性
30、蛋白的上樣量有沒(méi)有什么具體的要求?
答:上樣量要根據(jù)實(shí)驗(yàn)的要求來(lái)定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等,如果只是要定性,則沒(méi)有太大的關(guān)系,盡量多上就行了,但是不要超載。
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